More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34891 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  100 
 
 
579 aa  1196    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  45.36 
 
 
506 aa  238  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  44.07 
 
 
443 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  41.64 
 
 
449 aa  217  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  41.22 
 
 
473 aa  214  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  42.29 
 
 
455 aa  209  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  44.05 
 
 
449 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  42.24 
 
 
447 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  41.88 
 
 
447 aa  206  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  45.15 
 
 
448 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  43.08 
 
 
476 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  41.2 
 
 
435 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  39.03 
 
 
446 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  42.29 
 
 
503 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  42 
 
 
450 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  39.44 
 
 
569 aa  201  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  39.64 
 
 
442 aa  183  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  39.85 
 
 
457 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  39.42 
 
 
473 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  40.08 
 
 
481 aa  170  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  35.4 
 
 
480 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  40.43 
 
 
453 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  37.36 
 
 
468 aa  167  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  35.66 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.47 
 
 
454 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  36.97 
 
 
449 aa  160  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  32.09 
 
 
453 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  32.31 
 
 
453 aa  156  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  32.09 
 
 
453 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  31.97 
 
 
453 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  33.33 
 
 
453 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  33.33 
 
 
453 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  33.33 
 
 
453 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  33.33 
 
 
453 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  32.09 
 
 
453 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  35.71 
 
 
448 aa  154  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  31.76 
 
 
453 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  31.76 
 
 
453 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  34.92 
 
 
449 aa  144  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  32.05 
 
 
452 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  30.64 
 
 
458 aa  137  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  30.43 
 
 
570 aa  130  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.54 
 
 
454 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  30.43 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  33.78 
 
 
429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  29.65 
 
 
454 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  26.91 
 
 
479 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.25 
 
 
429 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  30.91 
 
 
425 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.66 
 
 
446 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  31.91 
 
 
475 aa  109  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  25.29 
 
 
469 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.9 
 
 
441 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  31.7 
 
 
463 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  31.76 
 
 
479 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.66 
 
 
494 aa  107  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  32.28 
 
 
466 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.02 
 
 
425 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  35.55 
 
 
431 aa  107  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  29.59 
 
 
426 aa  107  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  32.55 
 
 
425 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.2 
 
 
457 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  29.92 
 
 
477 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  31.45 
 
 
472 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  29.36 
 
 
475 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  29.36 
 
 
475 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  28.24 
 
 
474 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.65 
 
 
425 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  29.36 
 
 
475 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  30.71 
 
 
474 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  33.97 
 
 
422 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  30.04 
 
 
478 aa  105  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.15 
 
 
425 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  30.3 
 
 
464 aa  104  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3519  dihydropyrimidinase  27.4 
 
 
488 aa  104  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.51 
 
 
467 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  27.2 
 
 
479 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  27.2 
 
 
479 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  31.68 
 
 
471 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.53 
 
 
438 aa  102  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  33.03 
 
 
459 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  31.68 
 
 
471 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.42 
 
 
437 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.7 
 
 
435 aa  102  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.86 
 
 
425 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  33.17 
 
 
422 aa  102  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  30.52 
 
 
473 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  31.43 
 
 
442 aa  101  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  33.5 
 
 
436 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.23 
 
 
434 aa  100  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  27.2 
 
 
479 aa  100  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  29.88 
 
 
477 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  31.53 
 
 
478 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.92 
 
 
433 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  27.56 
 
 
470 aa  99.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  30.58 
 
 
471 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  28.88 
 
 
472 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  32.04 
 
 
428 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3650  dihydroorotase  27.88 
 
 
435 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311057  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  31.72 
 
 
484 aa  99  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>