89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46869 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46867  predicted protein  63.13 
 
 		 918 aa  1166    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.793152  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46869  predicted protein  100 
 
 		 956 aa  1960    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0965928  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27841  RND family transporter: Niemann-Pick type C1 disease protein-like protein  27.09 
 
 		 808 aa  245  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938041  normal  0.0539189 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02119  conserved hypothetical protein similar to Neimann-Pick sphingolipid transporter (Eurofung)  25.66 
 
 		 1271 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80838  predicted protein  24.41 
 
 		 1268 aa  95.9  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217919  normal  0.355381 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02470  vacuolar membrane protein, putative  24.56 
 
 		 1330 aa  86.3  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45835  predicted protein  22.02 
 
 		 1462 aa  77.4  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.720628  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29594  RND family transporter: Patched (Ptc) segmentation polarity protein  22.8 
 
 		 1183 aa  58.2  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3434  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  31.74 
 
 		 1055 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0847845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  28.4 
 
 		 861 aa  54.3  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86304  predicted protein  28.68 
 
 		 716 aa  54.3  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  29.91 
 
 		 1038 aa  53.5  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1576  RND superfmily multidrug/dye/detergent efflux pump AcrB  27.54 
 
 		 1075 aa  53.5  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00327215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0997  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.82 
 
 		 1042 aa  52.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3842  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  26.63 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267176  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1781  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.9 
 
 		 691 aa  50.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250213  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1219  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  26.51 
 
 		 1044 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25 
 
 		 764 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2111  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  26.11 
 
 		 1069 aa  50.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0570882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0810  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  29.94 
 
 		 1053 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0578255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3428  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  31.71 
 
 		 1076 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0888  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.71 
 
 		 1076 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0636311  hitchhiker  0.000716366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2696  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.14 
 
 		 1052 aa  49.7  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3498  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.57 
 
 		 1056 aa  49.7  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  27.53 
 
 		 905 aa  48.9  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.31 
 
 		 1041 aa  48.5  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.362215  unclonable  0.00000213823 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6464  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.87 
 
 		 1062 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118226 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5964  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.87 
 
 		 1065 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5600  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  27.87 
 
 		 1065 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  27.52 
 
 		 805 aa  48.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2326  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  25.49 
 
 		 1055 aa  48.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.155904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0373  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  31.82 
 
 		 1059 aa  48.1  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1336  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  26.73 
 
 		 1047 aa  48.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3368  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  24.31 
 
 		 1065 aa  47.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  26.97 
 
 		 1049 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.40035  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  27.98 
 
 		 1053 aa  47.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003894  acridine efflux pump  25.58 
 
 		 1053 aa  47.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1532  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  26.98 
 
 		 1049 aa  47.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.075861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2952  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  29.82 
 
 		 1055 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.513525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2837  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25.49 
 
 		 1055 aa  47.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143784  normal  0.226018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2374  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1034 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0122  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  26.29 
 
 		 1053 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.62255  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3448  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.99 
 
 		 1034 aa  47.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3305  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  30.77 
 
 		 1046 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  26.95 
 
 		 1048 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7711  acriflavin resistance protein  27.23 
 
 		 1017 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1651  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1026 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001386  cation/multidrug efflux pump  30.68 
 
 		 1027 aa  47  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2411  acriflavin resistance protein  27.23 
 
 		 1013 aa  47  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.848579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33000  RND family transporter: Dispatched segment polarity protein (cholesterol release)  25.3 
 
 		 1154 aa  46.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.69508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2965  aminoglycoside/multidrug efflux system  23.2 
 
 		 1037 aa  46.2  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3837  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  27.33 
 
 		 1049 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.790835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1373  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  34.15 
 
 		 1045 aa  46.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1029 aa  45.8  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  26.87 
 
 		 1045 aa  45.8  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  24 
 
 		 1024 aa  45.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0568  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25.9 
 
 		 1054 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4304  acriflavin resistance protein  22.54 
 
 		 1102 aa  45.8  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123043  normal  0.121863 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0776  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25.5 
 
 		 1055 aa  45.8  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  21.85 
 
 		 881 aa  45.8  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0582  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  31.14 
 
 		 1055 aa  45.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458894  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3583  AcrB protein  25.84 
 
 		 1037 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3584  AcrB protein  25.84 
 
 		 1037 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  32.95 
 
 		 1068 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3690  AcrB protein  25.84 
 
 		 1037 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.145421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5180  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  32.99 
 
 		 1055 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.565665  normal  0.0103301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3751  acriflavine resistance protein F  24.43 
 
 		 1034 aa  45.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0990355  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0689  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  29.41 
 
 		 1066 aa  45.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181022  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  28.57 
 
 		 1063 aa  45.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2655  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.57 
 
 		 1066 aa  44.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3494  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  24.85 
 
 		 1036 aa  44.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0440  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25 
 
 		 1034 aa  44.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.875483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4641  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  26.4 
 
 		 1052 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0463789  normal  0.947312 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  27.01 
 
 		 879 aa  44.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1194  hydrophobe/amphiphile efflux pump protein  27.27 
 
 		 1047 aa  44.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000151988  normal  0.324447 
 
 
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  40.74 
 
 		 1109 aa  44.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2368  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  29.17 
 
 		 1052 aa  44.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.465275  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  34.67 
 
 		 874 aa  44.7  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2567  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.9 
 
 		 1047 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.461697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1998  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  27.98 
 
 		 1066 aa  44.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.98 
 
 		 1066 aa  44.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0376  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  34.04 
 
 		 1049 aa  44.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433431  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2528  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.57 
 
 		 1066 aa  44.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.149577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2637  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.98 
 
 		 1066 aa  44.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0517  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  27.38 
 
 		 1055 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1850  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  28.57 
 
 		 1052 aa  44.3  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0763559 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  27.98 
 
 		 1066 aa  44.3  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3459  acriflavine resistance protein F  25 
 
 		 1034 aa  44.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0766453  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  25 
 
 		 1034 aa  44.3  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>