59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51953 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  100 
 
 
292 aa  603  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  60.49 
 
 
369 aa  249  5e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  47.85 
 
 
322 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  45.28 
 
 
404 aa  180  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  36.24 
 
 
633 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  38.02 
 
 
403 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  40.59 
 
 
378 aa  132  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  43.75 
 
 
463 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  34.3 
 
 
420 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  42.35 
 
 
438 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  37.06 
 
 
517 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.75 
 
 
979 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  35.4 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.73 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  32.18 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  33.99 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.14 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.59 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.1 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.63 
 
 
562 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.25 
 
 
612 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.71 
 
 
711 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.53 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.71 
 
 
711 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.36 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.34 
 
 
270 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.52 
 
 
301 aa  62.4  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.83 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.54 
 
 
907 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 
654 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.27 
 
 
633 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.26 
 
 
615 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.74 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 
612 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  28.48 
 
 
609 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.48 
 
 
789 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.57 
 
 
615 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  35 
 
 
781 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
648 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.42 
 
 
805 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 
900 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  28.4 
 
 
903 aa  52.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 
717 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.53 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.07 
 
 
1316 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.5 
 
 
641 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.21 
 
 
666 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  35.65 
 
 
898 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.68 
 
 
841 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.19 
 
 
850 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.75 
 
 
843 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.34 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  35.65 
 
 
890 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  29 
 
 
671 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3611  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
649 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.39 
 
 
428 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.47 
 
 
590 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>