58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48762 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48762  predicted protein  100 
 
 
416 aa  841    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07353  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16380)  26.09 
 
 
344 aa  119  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.550714 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05970  conserved hypothetical protein  27.44 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  26.65 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 
325 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04200  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 
400 aa  89.7  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 
349 aa  86.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65576  predicted protein  26.08 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  23.06 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4901  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
319 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.94 
 
 
353 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 
354 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  22.9 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 
356 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 
351 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 
365 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  22.3 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3670  oxidoreductase domain-containing protein  33.93 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998821  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  23.86 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37800  predicted dehydrogenase  34.82 
 
 
296 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  23.45 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  25.08 
 
 
366 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  21.97 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  21.97 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4385  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 
298 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4046  oxidoreductase domain-containing protein  33.05 
 
 
307 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.131768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  24.23 
 
 
350 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  23.01 
 
 
350 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 
329 aa  46.6  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  20.34 
 
 
357 aa  46.6  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 
355 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  24.46 
 
 
355 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  22.74 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  24.5 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  25.28 
 
 
330 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
353 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  34.43 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  27.44 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  23.75 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  31.51 
 
 
353 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  24.75 
 
 
330 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  26.89 
 
 
357 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  25.78 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  24.47 
 
 
345 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  20.21 
 
 
345 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  24.8 
 
 
372 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.52 
 
 
329 aa  43.9  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.42 
 
 
350 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 
352 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
315 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  24.42 
 
 
350 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.47 
 
 
328 aa  43.5  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>