More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43016 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_10195  valyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_8G04800)  42.59 
 
 		 1033 aa  821    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04124  valyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 951 aa  706    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3739  valyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 951 aa  702    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1460  valyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 955 aa  708    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 880 aa  657    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 887 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0977  valyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 948 aa  697    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1716  valyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 963 aa  683    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.894816  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 933 aa  658    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 921 aa  695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2236  valyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 968 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 943 aa  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0738  valyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 973 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1992  valyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 963 aa  689    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2085  valyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 953 aa  662    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000735472  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 958 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1268  valyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 948 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33832  predicted protein  52.18 
 
 		 1056 aa  1066    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1691  valyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 955 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3650  valyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 951 aa  701    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.227036 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0927  valyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 955 aa  708    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 921 aa  709    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 921 aa  707    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01880  valine-tRNA ligase, putative  46.08 
 
 		 1109 aa  942    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1086  valyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 948 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1850  valyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 984 aa  693    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.546477  normal  0.957317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 943 aa  683    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 933 aa  659    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0863  valyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 955 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 912 aa  733    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 879 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 1002 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1846  valyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 955 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 929 aa  746    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0986  valyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 948 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 884 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 885 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4585  valyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 955 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 925 aa  664    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 914 aa  658    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 887 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 883 aa  716    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 924 aa  723    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0741  valyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 955 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3169  valyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 979 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1137  putative valyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 941 aa  682    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.835272  normal  0.0253174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 909 aa  673    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 926 aa  695    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0923  valyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 959 aa  701    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 880 aa  717    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2633  valyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 955 aa  712    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2390  valyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 1052 aa  729    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 972 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 917 aa  715    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2376  valyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 990 aa  679    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 922 aa  727    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 952 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 943 aa  686    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3721  valyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 973 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0971795  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1335  valyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 959 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2867  valyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 968 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 968 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2922  valyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 947 aa  703    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.611801  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 865 aa  713    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2138  valyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 984 aa  689    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2630  valyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 955 aa  685    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00324916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0285  valyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 957 aa  666    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.147472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1669  valyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 955 aa  709    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 884 aa  651    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2896  valyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 976 aa  686    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.588712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0959  valyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 955 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42662  predicted protein  38.45 
 
 		 924 aa  657    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 947 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 921 aa  721    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 926 aa  673    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 886 aa  687    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 880 aa  654    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 948 aa  688    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 911 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 958 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 958 aa  705    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 917 aa  714    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0916  valyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 968 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.276486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 883 aa  662    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 1006 aa  648    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1321  valyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 955 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 950 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0422  valyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 955 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72245  valyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 1051 aa  902    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1035  valyl-tRNA synthetase  37.49 
 
 		 972 aa  651    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.570949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1441  valyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 955 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 892 aa  658    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 929 aa  728    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 958 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3112  valyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 958 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 886 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 953 aa  692    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2742  valyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 958 aa  707    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.829752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0393  valyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 952 aa  664    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 955 aa  653    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>