167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41450 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_41450  predicted protein  100 
 
 
291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01940  conserved hypothetical protein  36.79 
 
 
480 aa  77  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  38.04 
 
 
481 aa  75.9  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  36.79 
 
 
559 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  41.3 
 
 
246 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24530  predicted protein  38.04 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00133033  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  56 
 
 
125 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
82 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  48.15 
 
 
373 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  51.85 
 
 
116 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  40.58 
 
 
128 aa  59.3  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  40.51 
 
 
182 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  48.15 
 
 
115 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  41.67 
 
 
85 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  47.92 
 
 
112 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  47.92 
 
 
107 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  33.33 
 
 
477 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  36.11 
 
 
91 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  42.25 
 
 
104 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  38.89 
 
 
90 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  41.33 
 
 
132 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  40.35 
 
 
441 aa  55.8  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  36.11 
 
 
87 aa  55.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  38.78 
 
 
94 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  54 
 
 
524 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  48.28 
 
 
157 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  37.84 
 
 
81 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  41.33 
 
 
151 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  41.33 
 
 
152 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  27.03 
 
 
434 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  40 
 
 
134 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  32.61 
 
 
82 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
89 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  40.54 
 
 
150 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
149 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  38.98 
 
 
88 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  40.54 
 
 
148 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  37.23 
 
 
446 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  30.69 
 
 
89 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
155 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  36.23 
 
 
85 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 
88 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.11 
 
 
88 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  40 
 
 
176 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  36.11 
 
 
88 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  39.44 
 
 
176 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  40.38 
 
 
88 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  32.86 
 
 
92 aa  52.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  32.38 
 
 
499 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00790  RNA-binding protein, putative  29.73 
 
 
584 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  38.03 
 
 
121 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  41.18 
 
 
89 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
175 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  36.62 
 
 
124 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
181 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  43.64 
 
 
874 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  46.3 
 
 
103 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1508  RNA recognition motif-containing protein  36.67 
 
 
143 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  32.65 
 
 
88 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  41.18 
 
 
87 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  36.62 
 
 
123 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  38.03 
 
 
121 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  36.62 
 
 
122 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
86 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  34.52 
 
 
732 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  36.71 
 
 
552 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0300  RNA-binding region RNP-1  30.95 
 
 
145 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  33.72 
 
 
143 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  31.94 
 
 
88 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02141  RNA recognition motif-containing protein  36.67 
 
 
143 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  36.62 
 
 
162 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  36.11 
 
 
137 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  33.33 
 
 
143 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  27.97 
 
 
122 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  45.1 
 
 
87 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  33.33 
 
 
453 aa  49.7  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  28.74 
 
 
353 aa  49.3  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  51.06 
 
 
117 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
122 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  32.39 
 
 
91 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  32.86 
 
 
90 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  38.33 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  28.57 
 
 
687 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  36.62 
 
 
140 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  34.07 
 
 
83 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  47.83 
 
 
102 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  31.96 
 
 
158 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  35.66 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  34.62 
 
 
245 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  47.83 
 
 
102 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  36.54 
 
 
455 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  42.86 
 
 
119 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  32.99 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4005  RNA-binding region RNP-1  32.2 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.776629  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  32.86 
 
 
90 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  48.94 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  44.23 
 
 
146 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 
95 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>