207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32095 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  100 
 
 
679 aa  1371    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  37.91 
 
 
570 aa  359  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  31.01 
 
 
475 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  36.87 
 
 
550 aa  124  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  33.2 
 
 
467 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
456 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  33.2 
 
 
467 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  32.79 
 
 
467 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
546 aa  120  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 
538 aa  120  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  41.84 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
549 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  32.04 
 
 
549 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  31.85 
 
 
467 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  30.77 
 
 
537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  40.2 
 
 
553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  32.2 
 
 
554 aa  112  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
421 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  41.46 
 
 
507 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 
545 aa  110  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
575 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
575 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  37.5 
 
 
413 aa  109  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  32.95 
 
 
463 aa  109  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
424 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 
433 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 
545 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 
553 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  33.83 
 
 
553 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  29.66 
 
 
553 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 
545 aa  107  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 
455 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  33.83 
 
 
552 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
471 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  30.94 
 
 
553 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  30.49 
 
 
553 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  36.76 
 
 
545 aa  106  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  35.89 
 
 
549 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 
552 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  40.56 
 
 
566 aa  104  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 
552 aa  104  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  30.57 
 
 
547 aa  103  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  38.89 
 
 
556 aa  103  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 
464 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  25.92 
 
 
556 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 
464 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  36.52 
 
 
548 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  29.24 
 
 
551 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  33.75 
 
 
412 aa  102  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 
518 aa  99.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  32.02 
 
 
418 aa  98.2  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  37.64 
 
 
552 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  32.92 
 
 
424 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  34.73 
 
 
411 aa  94.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  31.62 
 
 
406 aa  94.4  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  29.34 
 
 
401 aa  93.2  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  36.21 
 
 
424 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
448 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  35.42 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  32.32 
 
 
428 aa  79  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  35.06 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
432 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  27.78 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  34.46 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  33.55 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  34.23 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  27.38 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
407 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  26.71 
 
 
402 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
407 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  34.68 
 
 
418 aa  66.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  27.17 
 
 
431 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  27.01 
 
 
433 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.71 
 
 
402 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.56 
 
 
402 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  26.97 
 
 
422 aa  65.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
393 aa  65.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  27.65 
 
 
400 aa  65.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.09 
 
 
402 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.09 
 
 
402 aa  65.1  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.09 
 
 
402 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2467  putative oxalate:formate antiporter  28.24 
 
 
358 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000134244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.09 
 
 
402 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.09 
 
 
402 aa  63.9  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  27.65 
 
 
400 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 
416 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  25.33 
 
 
408 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  38.04 
 
 
938 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  25.47 
 
 
402 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  26.06 
 
 
402 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  31.71 
 
 
442 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.28 
 
 
402 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  38.05 
 
 
382 aa  62  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  26.47 
 
 
400 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  26.47 
 
 
400 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  26.47 
 
 
400 aa  60.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  26.47 
 
 
400 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>