More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14785 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_14785  predicted protein  100 
 
 
176 aa  369  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50084  predicted protein  77.84 
 
 
260 aa  290  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00130  thioredoxin peroxidase, putative  46.37 
 
 
233 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  48.3 
 
 
212 aa  178  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  48.3 
 
 
211 aa  174  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  48.3 
 
 
211 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  46.02 
 
 
217 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  46.59 
 
 
212 aa  167  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  48.3 
 
 
213 aa  167  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  45.45 
 
 
212 aa  167  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  44.89 
 
 
212 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  44.89 
 
 
212 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  45.45 
 
 
212 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  45.45 
 
 
212 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  44.89 
 
 
211 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  44.89 
 
 
211 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  45.45 
 
 
212 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  45.45 
 
 
212 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  46.59 
 
 
212 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  46.02 
 
 
212 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  46.02 
 
 
212 aa  165  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  46.02 
 
 
211 aa  165  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  45.45 
 
 
212 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  45.45 
 
 
212 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  45.45 
 
 
212 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  44.32 
 
 
212 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  44.32 
 
 
212 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  46.02 
 
 
211 aa  165  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  45.45 
 
 
211 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  46.02 
 
 
212 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  46.02 
 
 
212 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  44.89 
 
 
212 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  44.89 
 
 
210 aa  164  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  45.45 
 
 
212 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  45.45 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0121  1-Cys peroxiredoxin  45.45 
 
 
214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  hitchhiker  0.000177221 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  45.45 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.45 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  45.45 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  47.16 
 
 
208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.45 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.45 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.45 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  45.45 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.45 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  46.02 
 
 
220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  44.89 
 
 
212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  45.25 
 
 
261 aa  162  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  46.02 
 
 
212 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  45.45 
 
 
212 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  42.05 
 
 
212 aa  161  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  43.75 
 
 
211 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  43.75 
 
 
212 aa  160  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  47.73 
 
 
210 aa  160  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  44.32 
 
 
213 aa  160  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  44.32 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  43.75 
 
 
213 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  44.32 
 
 
212 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1639  Peroxidase  41.99 
 
 
219 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.160571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  43.18 
 
 
213 aa  158  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.29 
 
 
213 aa  157  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  44.32 
 
 
212 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2374  1-Cys peroxiredoxin  43.18 
 
 
216 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1458  Peroxidase  40.88 
 
 
219 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  42.46 
 
 
217 aa  155  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  45.14 
 
 
213 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  44.32 
 
 
212 aa  155  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  45.71 
 
 
213 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  42.61 
 
 
212 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  44.32 
 
 
215 aa  154  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  43.75 
 
 
213 aa  154  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  43.18 
 
 
212 aa  153  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  40.91 
 
 
212 aa  153  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  42.05 
 
 
211 aa  153  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  42.05 
 
 
213 aa  153  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  42.22 
 
 
218 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3637  Peroxidase  43.41 
 
 
218 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0335731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  43.18 
 
 
212 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  41.11 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  39.33 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0075  1-Cys peroxiredoxin  44.44 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  43.75 
 
 
213 aa  151  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  45.51 
 
 
229 aa  151  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  41.34 
 
 
217 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  42.61 
 
 
217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4841  peroxidase  40.88 
 
 
219 aa  150  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2758  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.62 
 
 
220 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  41.9 
 
 
213 aa  150  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2647  Peroxidase  42.31 
 
 
220 aa  150  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4963  peroxidase  39.78 
 
 
219 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419029  hitchhiker  0.00950513 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  45.4 
 
 
221 aa  150  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  43.18 
 
 
208 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  43.68 
 
 
212 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4088  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.67 
 
 
219 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4916  thioredoxin peroxidase (AhpC, Alkyl hydroperoxide reductase)  42.31 
 
 
219 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  41.9 
 
 
217 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  41.48 
 
 
212 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  41.9 
 
 
221 aa  147  5e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  41.48 
 
 
209 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  40.91 
 
 
213 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>