54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1565 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1565  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 441 aa  886    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  98.19 
 
 		 441 aa  868    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0902999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0975  TPR repeat-containing protein  40.69 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421102  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0567  tetratricopeptide TPR_2  40.24 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3260  tetratricopeptide TPR_2  37.91 
 
 		 434 aa  270  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2216  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 170 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 602 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 503 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0009  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.25 
 
 		 620 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 1406 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 718 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.06 
 
 		 737 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3726  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000157755  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  33.98 
 
 		 561 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.06 
 
 		 887 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 593 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 700 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 601 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 842 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 804 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  37.33 
 
 		 638 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 573 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0905  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 		 253 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3293  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.32 
 
 		 129 aa  47  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00167257  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  33.98 
 
 		 561 aa  47.4  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 296 aa  47  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 542 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 602 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 878 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 637 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.95 
 
 		 594 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  31.78 
 
 		 837 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 3301 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  31.07 
 
 		 577 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 649 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.93 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.79 
 
 		 875 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 649 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  35.29 
 
 		 816 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 824 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.8 
 
 		 622 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  29.35 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02135  aerotolerance-related exported protein  36.25 
 
 		 299 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1321  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 181 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000464925  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0681  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 549 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.607702  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 697 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 3560 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.52 
 
 		 565 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  30.51 
 
 		 577 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 866 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  37.8 
 
 		 482 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 681 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>