15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0567 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0567  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 462 aa  929    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0975  TPR repeat-containing protein  65.8 
 
 		 436 aa  570  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421102  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1565  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.24 
 
 		 441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.24 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0902999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3260  tetratricopeptide TPR_2  34.64 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0009  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.23 
 
 		 620 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.67 
 
 		 725 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 744 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 718 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 573 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0887  Tetratricopeptide domain protein  26.9 
 
 		 1339 aa  43.9  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.102317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 		 565 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  35.53 
 
 		 638 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 587 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>