66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1318 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  62.67 
 
 
138 aa  183  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  60.27 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  55.1 
 
 
137 aa  161  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.54 
 
 
137 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.25 
 
 
138 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.52 
 
 
138 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.14 
 
 
138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  56.39 
 
 
141 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  64.55 
 
 
141 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.04 
 
 
138 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.34 
 
 
144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  45.89 
 
 
138 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  55.77 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.15 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  54.81 
 
 
138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  51.92 
 
 
147 aa  120  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.61 
 
 
139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  51.92 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  43.05 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.57 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  53 
 
 
138 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  44.85 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.46 
 
 
179 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  46.67 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  39.17 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  31.76 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  36.3 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.57 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  35.71 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.46 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  35.71 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  36.07 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  34.51 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  35.79 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  40.66 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  32.17 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  32.17 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  32.41 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  37.37 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  33.83 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  28.99 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  37.89 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  30.91 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  33.59 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.86 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.19 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  33.62 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  35.19 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  33.62 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  33.62 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  37.93 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  33.98 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  29.23 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  37.04 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  29.92 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  31.36 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  30.19 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>