More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0596 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  100 
 
 		 278 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  99.28 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  64.34 
 
 		 289 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  63.22 
 
 		 284 aa  348  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  59.25 
 
 		 283 aa  332  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  60.23 
 
 		 278 aa  332  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  59.39 
 
 		 281 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  53.44 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  47.65 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  45.7 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  46.09 
 
 		 291 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  42.8 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  44.36 
 
 		 291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  42.97 
 
 		 314 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  38.58 
 
 		 279 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  38.19 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  37.31 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  37.4 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  41.94 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  40.28 
 
 		 367 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  34.63 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  34.63 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  36.65 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  35.56 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  34.39 
 
 		 286 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  34.51 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.92 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  34.89 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  34.97 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  33.56 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  34.97 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  32.98 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  34.28 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  33.92 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 		 375 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  32.19 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 		 286 aa  159  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  33.22 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.69 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  31.34 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  34.77 
 
 		 370 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  32.04 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 		 328 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 368 aa  152  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  32.41 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  30.39 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 		 366 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 		 366 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 		 378 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  31.1 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  34.31 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 369 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  33.69 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  32.07 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  34.25 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 		 367 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 286 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  34.59 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.21 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 		 378 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.5 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  31.45 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.5 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  29.97 
 
 		 534 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.14 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  31.54 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  32.16 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.33 
 
 		 742 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.56 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  29.47 
 
 		 366 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.74 
 
 		 748 aa  142  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  30.94 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.4 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  29.12 
 
 		 366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  31.72 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  31.72 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  30.71 
 
 		 366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.75 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  36.4 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.47 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  30.28 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  33.09 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.71 
 
 		 735 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  29.68 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  30.63 
 
 		 367 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  29.14 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  29.93 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>