180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5485 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5485  Radical SAM domain protein  100 
 
 
316 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.269586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2193  Radical SAM domain protein  62.26 
 
 
336 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00124948 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1575  Radical SAM domain protein  42.31 
 
 
342 aa  239  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1576  Radical SAM domain protein  46.64 
 
 
423 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  34.6 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 
281 aa  99.8  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  31.92 
 
 
245 aa  90.9  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 
258 aa  90.5  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  32.47 
 
 
261 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 
256 aa  85.9  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  30 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  29.8 
 
 
353 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  29.83 
 
 
182 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2479  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  30.46 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  26.92 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  31.4 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  28.64 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  28.64 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  27.78 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  28.79 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  27.86 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  26.64 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  28.79 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  27.27 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  26.77 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  29.29 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  28.86 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2633  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 
343 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.346607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  28.86 
 
 
387 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 
386 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  29.85 
 
 
385 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  28.86 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  29.02 
 
 
378 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1163  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000309895 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0222  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 
357 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  27.96 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 
421 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  28.19 
 
 
355 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  29.21 
 
 
352 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 
270 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 
385 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 
437 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1745  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 
360 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
372 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  24.87 
 
 
360 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 
357 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 
381 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 
300 aa  62.8  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 
362 aa  62.4  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 
352 aa  62.4  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
242 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  23.59 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 
374 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
385 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
385 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
385 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
242 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  25.38 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  26.88 
 
 
362 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3708  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 
354 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000832138  hitchhiker  0.000000507033 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  28.14 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  25.76 
 
 
417 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 
376 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>