132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5226 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  100 
 
 		 193 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  52.22 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  51.67 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  47.34 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0568  hypothetical protein  44.02 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  35.59 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1369  nucleic acid-binding OB-fold tRNA/helicase-type protein  36.41 
 
 		 188 aa  117  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1801  hypothetical protein  35.2 
 
 		 198 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3959  hypothetical protein  37.7 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000666734  hitchhiker  0.00242089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1773  hypothetical protein  34.69 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  36.07 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2372  hypothetical protein  33.51 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 614 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.62 
 
 		 595 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  34.21 
 
 		 569 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  38.16 
 
 		 623 aa  58.2  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  35.05 
 
 		 623 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  28.92 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  35.44 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  35.44 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  35.05 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  35.44 
 
 		 610 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  28.92 
 
 		 535 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  30.49 
 
 		 597 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 		 597 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  29.87 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.89 
 
 		 636 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 		 626 aa  55.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.33 
 
 		 597 aa  55.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  33.77 
 
 		 572 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 		 636 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 		 596 aa  55.1  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 		 596 aa  54.7  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  33.8 
 
 		 112 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 		 603 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  33.8 
 
 		 112 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  33.8 
 
 		 112 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  34.78 
 
 		 635 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1111  hypothetical protein  33.73 
 
 		 102 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188451  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 		 602 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  32.1 
 
 		 97 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  32.39 
 
 		 134 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.89 
 
 		 677 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  32.1 
 
 		 97 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  27.38 
 
 		 614 aa  52.4  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  28.21 
 
 		 597 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2241  hypothetical protein  25.29 
 
 		 109 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  29.58 
 
 		 107 aa  52  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36.76 
 
 		 108 aa  51.6  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 		 575 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 		 562 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  30.56 
 
 		 103 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  32.04 
 
 		 626 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  34.67 
 
 		 572 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  32.04 
 
 		 626 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  29.73 
 
 		 120 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  28.57 
 
 		 594 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4743  hypothetical protein  31.58 
 
 		 83 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  32.14 
 
 		 104 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  31.46 
 
 		 102 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  35.06 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  34.85 
 
 		 600 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1863  cobalamin cluster protein CbiX 2 (ferredoxin- like iron-sulfur protein)  35.29 
 
 		 112 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 		 640 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  30.99 
 
 		 102 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  27.63 
 
 		 592 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  30.38 
 
 		 552 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0592  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding 51 kD subunit  29.76 
 
 		 95 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  25.64 
 
 		 597 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  44.07 
 
 		 102 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 		 545 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  40.68 
 
 		 102 aa  46.2  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5162  hypothetical protein  31.18 
 
 		 121 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.245417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 		 604 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  26.47 
 
 		 101 aa  45.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  33.78 
 
 		 105 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  33.78 
 
 		 105 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  45.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  33.78 
 
 		 105 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2936  hypothetical protein  30.68 
 
 		 109 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  26.76 
 
 		 108 aa  44.7  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  33.78 
 
 		 105 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  31.34 
 
 		 130 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  33.78 
 
 		 109 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  33.78 
 
 		 109 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  32.39 
 
 		 120 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  30.34 
 
 		 102 aa  44.7  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  32.43 
 
 		 105 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  27.71 
 
 		 624 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  25 
 
 		 543 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  27.27 
 
 		 132 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  45.45 
 
 		 105 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  45.45 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  32.69 
 
 		 598 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  31.43 
 
 		 102 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  37.14 
 
 		 124 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  45.45 
 
 		 105 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  45.45 
 
 		 105 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>