91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1863 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1863  cobalamin cluster protein CbiX 2 (ferredoxin- like iron-sulfur protein)  100 
 
 		 112 aa  225  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3465  hypothetical protein  61.26 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5162  hypothetical protein  53.77 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.245417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  34.88 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  34.12 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  35.71 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  37.08 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  31.46 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  38.75 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  33.71 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  33.73 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  32.94 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  31.46 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  32.18 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  33.71 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  33.71 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  35.87 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  33.77 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  34.52 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  30 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  31.68 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  28.24 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  30.43 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  29.03 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  29.03 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  34.38 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  40.85 
 
 		 534 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  32.58 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  28.57 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  29.21 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  36.05 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  35.29 
 
 		 193 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  36.05 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  36.05 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  34.88 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.42 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  30.86 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  32.1 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.24 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 		 572 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.24 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  26.74 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  26.67 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  29.41 
 
 		 596 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  32.1 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  32.56 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  28 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  32.56 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  25.84 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  29.21 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  26.6 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  29.55 
 
 		 595 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  28.74 
 
 		 602 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  27.91 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  27.59 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  26.37 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  27.59 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 		 598 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.82 
 
 		 408 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  27.59 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  27.59 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  28.57 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  29.55 
 
 		 596 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.68 
 
 		 410 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  32.94 
 
 		 607 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  32.94 
 
 		 607 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  30.68 
 
 		 597 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  27.71 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  26.67 
 
 		 130 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 636 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  30.11 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  32 
 
 		 626 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  31.63 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.33 
 
 		 636 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  32 
 
 		 626 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  30.77 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  28.41 
 
 		 597 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  28.41 
 
 		 597 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  29.21 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  26.88 
 
 		 614 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  27.06 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  31.76 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1759  ferredoxin, 2Fe-2S  28.38 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.370583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  26.44 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  26.44 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  26.44 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  26.51 
 
 		 105 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  26.44 
 
 		 108 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>