43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5162 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5162  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  245  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.245417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1863  cobalamin cluster protein CbiX 2 (ferredoxin- like iron-sulfur protein)  53.77 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3465  hypothetical protein  60.22 
 
 
116 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  34.74 
 
 
100 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  33.68 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  30.43 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  32.61 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.89 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  35.53 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  30.77 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  34.21 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  31.03 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  28.57 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  31.87 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  31.11 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  31.87 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  31.87 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  29.79 
 
 
108 aa  47.4  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  31.18 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  26.97 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  28.72 
 
 
597 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  31.87 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  34.88 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  33.73 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  27.91 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  25.58 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  27.37 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 
562 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  27.37 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  27.59 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  29.55 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  28.57 
 
 
102 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  29.55 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  40.91 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  28.41 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  28.41 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  28.41 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  26.74 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  27.59 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  28.41 
 
 
105 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  23.26 
 
 
113 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  23.26 
 
 
113 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  25 
 
 
116 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0352386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>