155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0361 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 		 100 aa  209  7.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  95 
 
 		 100 aa  202  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  72.73 
 
 		 100 aa  153  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  67.02 
 
 		 100 aa  140  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  40.74 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  37.76 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  37.21 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  38.78 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  37.21 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  37.21 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  40.91 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  40.91 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  40.91 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  40.91 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  36.73 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  40.66 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  39.77 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  39.77 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  33.96 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  36.36 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  39.77 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  39.77 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  39.56 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  38.37 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  38.64 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  37.97 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  36.9 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  39.77 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  33.67 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  33.67 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  35.71 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  31.96 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  40.91 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  40.91 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  40.91 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  40.91 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  38.64 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  38.64 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  35.63 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  32.67 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  34.69 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  31.82 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  33 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  33 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  34.88 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  32.65 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  34.09 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  33.72 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  35.24 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  32.65 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  33.67 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  35.63 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  37.04 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  34.94 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  39.29 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  32.53 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  30.23 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  34.88 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  31.33 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.27 
 
 		 410 aa  60.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  32.63 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.56 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35.87 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  33.72 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  35.96 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1863  cobalamin cluster protein CbiX 2 (ferredoxin- like iron-sulfur protein)  31.46 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  30.77 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  32.1 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  35.96 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  34.12 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5162  hypothetical protein  33.68 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.245417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  37.65 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.36 
 
 		 408 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  33.68 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  34.48 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.94 
 
 		 595 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  35.29 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  32.56 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 		 596 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.94 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  34.15 
 
 		 597 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  34.48 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  32.1 
 
 		 569 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 		 597 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  34.38 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  32.1 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  28.12 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  29.67 
 
 		 543 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.91 
 
 		 410 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.93 
 
 		 597 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  32.18 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  27.71 
 
 		 597 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  29.89 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  32.94 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  28.92 
 
 		 572 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  48.72 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  28.74 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.93 
 
 		 636 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  30.59 
 
 		 343 aa  47.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>