202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0856 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  100 
 
 
113 aa  234  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  44.44 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 
596 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  34.07 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  47.06 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  44.12 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  31.25 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  26.42 
 
 
562 aa  65.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  34.07 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  29.25 
 
 
597 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  34.04 
 
 
602 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  33.33 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  33.73 
 
 
569 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  30.67 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
610 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  28.97 
 
 
595 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  32.73 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  34.09 
 
 
217 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  29.67 
 
 
572 aa  62  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 
596 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  33.33 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  28.21 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  50 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  32.58 
 
 
607 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  32.58 
 
 
607 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  28.57 
 
 
640 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  34.83 
 
 
597 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  31.4 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  41.07 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  31.18 
 
 
594 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  32.43 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  29.73 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  30.85 
 
 
597 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  31.46 
 
 
596 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  32.35 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.745288 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  41.07 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  32.43 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.61 
 
 
410 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  24.74 
 
 
572 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  34.09 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  32.43 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  34.44 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  34.44 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  32.91 
 
 
204 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  25.71 
 
 
640 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  30.39 
 
 
626 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  32.63 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2936  hypothetical protein  34.12 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  33.72 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  31.17 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0160  hypothetical protein  34.12 
 
 
290 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  31.96 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  26.58 
 
 
222 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  31.11 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  31.58 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  31.65 
 
 
219 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  32.99 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  27.93 
 
 
635 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  29.87 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.33 
 
 
597 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  23.58 
 
 
677 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  31.18 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  31.52 
 
 
597 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 
575 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  31.91 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  42.03 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  42.03 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  31.46 
 
 
592 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  30.23 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  25.23 
 
 
636 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  33.72 
 
 
226 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.56 
 
 
408 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  31.76 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  31.76 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  32.98 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0840  ferredoxin, 2fe-2s  32.43 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  30.34 
 
 
603 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  31.25 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  29.79 
 
 
614 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  31.25 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  26.67 
 
 
641 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  42.31 
 
 
109 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.22 
 
 
410 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  38.96 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  23.42 
 
 
636 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  29.59 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  45.61 
 
 
178 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  42.31 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  44.23 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  32.65 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  50 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  34.62 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  38.98 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  27.88 
 
 
588 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  32.35 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  34.38 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  32.5 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  34.38 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  32.26 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>