176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1014 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  100 
 
 		 106 aa  221  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  59.6 
 
 		 100 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  57.84 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  56.86 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1759  ferredoxin, 2Fe-2S  56.44 
 
 		 103 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.370583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  54.9 
 
 		 102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  56.86 
 
 		 102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  57.43 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  56.44 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1150  ferredoxin, 2Fe-2S  53.47 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2619  ferredoxin, 2Fe-2S  48 
 
 		 100 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0840  ferredoxin, 2fe-2s  47.87 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  45.1 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  43.14 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  42.57 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  35.71 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  34.95 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  33.98 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  33.98 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  36.08 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  34.58 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  34.31 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  33 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  31.96 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.63 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  30.93 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  38.24 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  31 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  34.09 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  32.18 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  33.33 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  37.65 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  31 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  33.65 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  33.33 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  26.47 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  33.33 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  33.33 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  31.37 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  29.41 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.32 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.32 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  35.29 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  25.49 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  34.34 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  34.07 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35.92 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  30.53 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  35.29 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  38.95 
 
 		 597 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  37.33 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  33.33 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  31.19 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  32.14 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  30 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  28.57 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2936  hypothetical protein  37.62 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  34 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  31.91 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  37.14 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  32.63 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 		 596 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  33.98 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  39.58 
 
 		 597 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  26.21 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2408  ferredoxin-like protein  47.17 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  35.96 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  31.73 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  31.73 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  34.69 
 
 		 572 aa  52.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  37.89 
 
 		 596 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 		 569 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  36.67 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  32.95 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  34.15 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  34.15 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  30.68 
 
 		 178 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.33 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  34.94 
 
 		 600 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  29.59 
 
 		 217 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  47.62 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 		 595 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  32.56 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  31.03 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1111  hypothetical protein  33.78 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188451  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  32.99 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  32.99 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  29 
 
 		 597 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>