208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1738 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  100 
 
 		 114 aa  236  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  70.09 
 
 		 110 aa  165  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  58.97 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  58.62 
 
 		 120 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  48 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  44.55 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  44.23 
 
 		 134 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  46.94 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  43.16 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  43.56 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  42.57 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  40.95 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  42.57 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  42.57 
 
 		 105 aa  84.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  42.57 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  42.57 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  44.33 
 
 		 112 aa  84.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  44.33 
 
 		 112 aa  84.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  42.57 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  42.57 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  42.57 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  44.33 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  42.57 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  43.56 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  39.8 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  41.67 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  39.05 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  40.95 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  40.95 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  40.95 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  40.95 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  40.95 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  40.59 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  40.95 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  35.05 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  40.59 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  35.85 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  40.59 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  38.38 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  38.38 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  38.24 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  37.62 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  37.62 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  34.38 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  39.39 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  34.69 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  40 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  38.38 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  37.96 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  37.96 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  35.92 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35.35 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  36.73 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1759  ferredoxin, 2Fe-2S  35.71 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.370583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  34.31 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  39.05 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  35.71 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  37.11 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  35.71 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  39.39 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  35.64 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  38.61 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  38.78 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  34.65 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  33.67 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  36.19 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  35.87 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  35.35 
 
 		 595 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  32.67 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  38.14 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  36.63 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  32.71 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  32.71 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1150  ferredoxin, 2Fe-2S  37.8 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  37.25 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  37.25 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  36.19 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 		 569 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  31.65 
 
 		 614 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0333  ferredoxin, 2Fe-2S  34.02 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  32.04 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  37.37 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  33.33 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  41.25 
 
 		 626 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  34.65 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  31.63 
 
 		 572 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  33.01 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  33.67 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  31.31 
 
 		 597 aa  60.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  30.93 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  36.9 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  32.69 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  36.08 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  29.82 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  31.31 
 
 		 597 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  34.04 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  41.43 
 
 		 623 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>