62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3465 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3465  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  236  8e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1863  cobalamin cluster protein CbiX 2 (ferredoxin- like iron-sulfur protein)  61.26 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5162  hypothetical protein  60.22 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.245417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  35.71 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  30.48 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  31.11 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  34.88 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  29.55 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  34.88 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  34.88 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  29.55 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  34.15 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  28.18 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  26.53 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.97 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  28.87 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  32.58 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  30.48 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  29.29 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  34.04 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  28.24 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  33.33 
 
 		 193 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  26.36 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  30.12 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  30.69 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  28.41 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  30.3 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  26.36 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  26.42 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  34.88 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  28.77 
 
 		 597 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  29.73 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  29.67 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  31.63 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  26.61 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  29.67 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  23.23 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  23.23 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  27.27 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  25.47 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  23.23 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  23.23 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  24.72 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  24.3 
 
 		 107 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  24.53 
 
 		 106 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  23.96 
 
 		 105 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1169  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  50 
 
 		 160 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.516989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  30.43 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  24.74 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  25.23 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  23.23 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  29.29 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  31.33 
 
 		 607 aa  40.4  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  26.44 
 
 		 602 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  31.33 
 
 		 607 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  47.5 
 
 		 626 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  33.78 
 
 		 636 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  47.5 
 
 		 626 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  25.56 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.78 
 
 		 636 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>