211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1544 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  63.93 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  36.08 
 
 		 607 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  36.08 
 
 		 607 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  31.13 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  33.03 
 
 		 602 aa  68.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 		 610 aa  67.4  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  40.24 
 
 		 596 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  34.07 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  32.08 
 
 		 569 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  33.02 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  33.02 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  33.02 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  30 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  35.05 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  36.46 
 
 		 539 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  34.78 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  36.67 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  29.63 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  31.63 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  34.94 
 
 		 641 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  37.89 
 
 		 597 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  33.33 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 		 596 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  30.21 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  32.63 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  34.52 
 
 		 572 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  31.63 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.88 
 
 		 636 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  33.01 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  30.34 
 
 		 677 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  29.59 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 		 603 aa  58.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  34.15 
 
 		 597 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.72 
 
 		 636 aa  57.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  30.77 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  29.09 
 
 		 635 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  34.38 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  34.38 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  34.38 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  34.38 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  34.07 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 		 595 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  34.38 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.02 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  31.33 
 
 		 640 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  30.23 
 
 		 640 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  31.58 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 		 614 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  29.03 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  29.25 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  34.74 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.59 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  30.11 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  28.12 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  28.12 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  31.76 
 
 		 596 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.59 
 
 		 410 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  28.04 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  35.79 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  35.79 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 		 597 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35 
 
 		 273 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.71 
 
 		 597 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  31.33 
 
 		 572 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  29.13 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  29.17 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.63 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  31.25 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  32.65 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  30.3 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  30.43 
 
 		 249 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  34.38 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1599  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1111  hypothetical protein  39.24 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188451  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  33.67 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  32.58 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  32.58 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  30 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  27.66 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  29.17 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  31.18 
 
 		 226 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  31.25 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  30.21 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  24.27 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  30.21 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  30.21 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  30.21 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  30.21 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  31.91 
 
 		 106 aa  50.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  22.81 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  38.2 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  22.81 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  30.21 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  24.72 
 
 		 614 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>