126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2884 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1599  hypothetical protein  43.97 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  39.13 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.2 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  34.95 
 
 		 115 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  34.95 
 
 		 115 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 		 572 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 562 aa  62.8  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4568  hypothetical protein  29.67 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  31.63 
 
 		 572 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  34.44 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  30.53 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  33 
 
 		 103 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 		 569 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  30.38 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  28.41 
 
 		 597 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 		 575 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  30.11 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  30.11 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  31.91 
 
 		 107 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  35.64 
 
 		 112 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  33.72 
 
 		 113 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  35.63 
 
 		 596 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  35.64 
 
 		 112 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  30.85 
 
 		 117 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2241  hypothetical protein  31.25 
 
 		 109 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 		 602 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  33.73 
 
 		 610 aa  53.9  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  35.64 
 
 		 112 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.82 
 
 		 597 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  32.63 
 
 		 109 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  29.35 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  31.58 
 
 		 116 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  28.57 
 
 		 677 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0912  ferredoxin-like protein  32.65 
 
 		 126 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0934  ferredoxin-like protein  32.65 
 
 		 126 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  30.23 
 
 		 102 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35.9 
 
 		 108 aa  52.4  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  29.9 
 
 		 118 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  29.55 
 
 		 596 aa  52  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  28.09 
 
 		 614 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  28.41 
 
 		 607 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  31.37 
 
 		 114 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  28.41 
 
 		 607 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  30.53 
 
 		 112 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.19 
 
 		 410 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 		 597 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  25.84 
 
 		 614 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  31.18 
 
 		 132 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  31.25 
 
 		 139 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  30.59 
 
 		 109 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  29.17 
 
 		 132 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  29.17 
 
 		 132 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1171  ferredoxin-like protein  34.88 
 
 		 125 aa  48.9  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  32.18 
 
 		 102 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  31.58 
 
 		 109 aa  48.9  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  32.29 
 
 		 128 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  26.88 
 
 		 133 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  31.48 
 
 		 134 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  29.47 
 
 		 102 aa  48.5  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  38.89 
 
 		 103 aa  48.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 588 aa  48.5  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  28.74 
 
 		 121 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  31.11 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  28.41 
 
 		 595 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  30.43 
 
 		 104 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  31.58 
 
 		 570 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0994  ferredoxin-like protein  28.57 
 
 		 126 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  29.63 
 
 		 108 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  30.68 
 
 		 641 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  32.63 
 
 		 603 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  31.73 
 
 		 343 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 110 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 		 636 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  30.95 
 
 		 636 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  28.95 
 
 		 109 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  26.25 
 
 		 594 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  31.58 
 
 		 108 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  37.29 
 
 		 107 aa  45.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2619  ferredoxin, 2Fe-2S  32 
 
 		 100 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  30.86 
 
 		 107 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  38.6 
 
 		 119 aa  45.1  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  32.43 
 
 		 102 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  29.17 
 
 		 569 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0840  ferredoxin, 2fe-2s  28.57 
 
 		 100 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 		 597 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  32.43 
 
 		 102 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  27.47 
 
 		 106 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  25.53 
 
 		 597 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.28 
 
 		 109 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  25 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  32.81 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.95 
 
 		 408 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0174  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  32.39 
 
 		 119 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  33.33 
 
 		 113 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.65 
 
 		 410 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  29.27 
 
 		 535 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  36.21 
 
 		 101 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>