161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1957 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 		 102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  88.24 
 
 		 102 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  88.24 
 
 		 102 aa  193  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  86.14 
 
 		 102 aa  191  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  87.25 
 
 		 103 aa  189  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  85.29 
 
 		 102 aa  189  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1759  ferredoxin, 2Fe-2S  81.37 
 
 		 103 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.370583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  57.84 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1150  ferredoxin, 2Fe-2S  56.84 
 
 		 100 aa  114  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  53.92 
 
 		 100 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0840  ferredoxin, 2fe-2s  51.49 
 
 		 100 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2619  ferredoxin, 2Fe-2S  49.5 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  45.63 
 
 		 102 aa  94  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  42.16 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  43.56 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  42.86 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  36.73 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.71 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  37.65 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  40.54 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  40 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  40 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  38.38 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  39.13 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  36.08 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  36.08 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  36.08 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  39.33 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.29 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.33 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  35.11 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  34.04 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  34.04 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  34.02 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  34.04 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  34.04 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  34.04 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  33.66 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  36.27 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  36.36 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  34.02 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  36.26 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  40 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  36.08 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  36.08 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  36.08 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  36.08 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  36.08 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  31.03 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  34.83 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  30.69 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  35.23 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  34.07 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  35.56 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  32.56 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36.63 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  34.04 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  32.47 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36.63 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  33 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  38.64 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  34.44 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  35.16 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  31.63 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.35 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  35.71 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  34.48 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  34 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  36.62 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  34.02 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  33.66 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  32.95 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  36.25 
 
 		 640 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  34.62 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  30.85 
 
 		 569 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  35.16 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  31.65 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  35.53 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  32.98 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  37.11 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  34.18 
 
 		 640 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  38.2 
 
 		 597 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30 
 
 		 410 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  40.28 
 
 		 575 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0333  ferredoxin, 2Fe-2S  30.77 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  32.38 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  39.19 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  33.72 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  37.5 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  36.46 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  33.72 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  34.02 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  29.17 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  35.8 
 
 		 219 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  34 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 		 597 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  34.12 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  34.12 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  31.31 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  29.41 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>