88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0840 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0840  ferredoxin, 2fe-2s  100 
 
 		 100 aa  206  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2619  ferredoxin, 2Fe-2S  77.32 
 
 		 100 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  50.51 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  52 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  51.02 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  51.49 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  48.48 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1759  ferredoxin, 2Fe-2S  47.47 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.370583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  48.51 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1150  ferredoxin, 2Fe-2S  48.45 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  45.54 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  47.87 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  38.3 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  37.89 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  40.86 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  34.38 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  33.68 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  29.17 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  29.17 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.33 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  29.17 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  31.18 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  32.43 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  31.11 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  28.09 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  24.51 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  27.08 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  27.96 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 		 596 aa  47.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  32.22 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  28.89 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  28.57 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  28.28 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  32.1 
 
 		 596 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1599  hypothetical protein  38.18 
 
 		 246 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  26.88 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  27.03 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  36.14 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  32.61 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  25.68 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  30 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0333  ferredoxin, 2Fe-2S  30.77 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  25.26 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  27.1 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  27.27 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  29.41 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  27.55 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  37.31 
 
 		 640 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  34.92 
 
 		 569 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  23.91 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  38.81 
 
 		 640 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.27 
 
 		 410 aa  43.5  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  34.12 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0568  hypothetical protein  35.56 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  34.12 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  28.26 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 		 600 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  34.15 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  31.82 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  28.26 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  30.21 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  34.62 
 
 		 535 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  28.26 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  28.85 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  26.44 
 
 		 147 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  24.1 
 
 		 139 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  31.33 
 
 		 614 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 		 575 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  37.14 
 
 		 249 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  28.57 
 
 		 677 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 		 535 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  34.62 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2408  ferredoxin-like protein  39.62 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  27.91 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  25.53 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  27.27 
 
 		 105 aa  40.8  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  30.34 
 
 		 603 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  27.27 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  28.74 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.27 
 
 		 273 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  37.1 
 
 		 597 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  32.79 
 
 		 594 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  28.24 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  36.36 
 
 		 641 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  27.27 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  31.48 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  37.5 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>