167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_13331 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  100 
 
 
116 aa  238  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  89.66 
 
 
116 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  92.86 
 
 
113 aa  217  6e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  49.53 
 
 
120 aa  120  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  50.94 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  50.91 
 
 
114 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.745288 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  44.23 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  46.15 
 
 
178 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  39.81 
 
 
130 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  39.25 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  39.25 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  37.84 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  34 
 
 
120 aa  84.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  38 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  38 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  36 
 
 
128 aa  84  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  30.1 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  28.16 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  25.49 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  25.49 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  28.04 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  26.47 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  26.47 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  34.65 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  29.46 
 
 
343 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  26.47 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  30.69 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  28.43 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  30.61 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  28.7 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  28.7 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  28.72 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  30.21 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  26.61 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  28.72 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  28.72 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  29.91 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  32.69 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  33.01 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  27.55 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  27 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  39.62 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  28.57 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  37.74 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  27 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  28.71 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  29.7 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  27.18 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  29.52 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  23.47 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  27.62 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  33.72 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  25.49 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  28.12 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  43.75 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  39.62 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  43.48 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  39.47 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  28.17 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  37.5 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  27.88 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 
596 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  40 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  26.42 
 
 
607 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  24 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  26.42 
 
 
607 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.72 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  26.73 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  28.77 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  25 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  38 
 
 
597 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  26.53 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  26.53 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  26.47 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.84 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  39.58 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  32 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  37.5 
 
 
105 aa  52  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  26.58 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  37.5 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  26.73 
 
 
677 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  31.58 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  37.5 
 
 
105 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  37.5 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  37.5 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  37.5 
 
 
105 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  28 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  37.5 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  32 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  32 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  28 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  31.25 
 
 
101 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  27.1 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  35.29 
 
 
107 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  25.77 
 
 
602 aa  51.6  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  31.25 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  42.55 
 
 
594 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  32.2 
 
 
569 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  26 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  25.35 
 
 
598 aa  50.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>