141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0183 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  100 
 
 
128 aa  258  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  58.1 
 
 
132 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  58.1 
 
 
132 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  51.35 
 
 
158 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  51.35 
 
 
158 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  59 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  50.45 
 
 
147 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  49.54 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  46.36 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  42.45 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  43.56 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.745288 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  48 
 
 
119 aa  93.6  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  44 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  36 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  36.63 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  36 
 
 
116 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  39.05 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  40.82 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  38.38 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  37.62 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  40.21 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  37.5 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  37.5 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  37.5 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36.54 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  37.86 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  38.78 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  40.22 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  33.64 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  40 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  37.89 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  40.43 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  37.86 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  37.89 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  36.56 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  36.36 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  32.38 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  37.63 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  32.38 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  34.41 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  38.61 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  36.73 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  37.62 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  37.62 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  37.63 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  38 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  32.58 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  37.11 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  36.73 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  37.76 
 
 
217 aa  62  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  37.86 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  37.11 
 
 
110 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  33.67 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  35.35 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  37.72 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  34.95 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  32.65 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  35.35 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  35.35 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  34.95 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  36.08 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.07 
 
 
677 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  36.56 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  34.69 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  35 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  34.51 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  36.08 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  32.98 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  33.66 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  38.24 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  33.33 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  33.66 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  35.05 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  34.69 
 
 
108 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  35.05 
 
 
105 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  35.48 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  35.05 
 
 
105 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  35.05 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  35.05 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  33.66 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  30.3 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  36.27 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 
607 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 
607 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  34.91 
 
 
572 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1539  hypothetical protein  33.02 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 
610 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  32.98 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  31.87 
 
 
602 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  35.48 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  35.48 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  31.31 
 
 
596 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  39.71 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  32.41 
 
 
108 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>