197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0278 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  100 
 
 
106 aa  223  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  90.57 
 
 
134 aa  209  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  83.02 
 
 
109 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  83.02 
 
 
109 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  82.86 
 
 
108 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  70.37 
 
 
107 aa  157  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  71.3 
 
 
107 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  68.52 
 
 
107 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  70.75 
 
 
105 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  69.81 
 
 
105 aa  154  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  69.81 
 
 
105 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  68.87 
 
 
105 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  68.87 
 
 
105 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  68.87 
 
 
105 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  67.92 
 
 
105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  66.04 
 
 
105 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  64 
 
 
102 aa  147  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  66.04 
 
 
109 aa  146  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  66.04 
 
 
109 aa  146  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  64.08 
 
 
124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  66.04 
 
 
105 aa  144  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  64 
 
 
107 aa  143  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  66.04 
 
 
104 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  66.04 
 
 
104 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  66.04 
 
 
104 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  66.04 
 
 
108 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  64.71 
 
 
117 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  61.54 
 
 
131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  60.78 
 
 
127 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  59.8 
 
 
104 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  60.78 
 
 
103 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  59.22 
 
 
124 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  60.78 
 
 
123 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  57.84 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  57.84 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  57.43 
 
 
105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  58.82 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  59.8 
 
 
101 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  58.42 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  56.86 
 
 
102 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  56.86 
 
 
107 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  54.37 
 
 
103 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  55.34 
 
 
119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  52.88 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  52.88 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  44.34 
 
 
105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  43.4 
 
 
105 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  50 
 
 
133 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  44.76 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  40.57 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  40.38 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  40.38 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  40.38 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  43.88 
 
 
101 aa  87  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  40.38 
 
 
134 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  42.16 
 
 
130 aa  87  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  41.58 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  37.25 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  38.46 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.85 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35.35 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  37.14 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  38 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  37.37 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  37.37 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.02 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  36.79 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  38.83 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  31.37 
 
 
343 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  37.25 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  35.35 
 
 
596 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  35.29 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  31.73 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  32.32 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  31.37 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  31.37 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  39.22 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  37.89 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  36.36 
 
 
120 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  32.67 
 
 
100 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  36.36 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  31.31 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  35.24 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  39.53 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  32.67 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  32.11 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
597 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  32.32 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 
572 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  32.32 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  37.74 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  32.32 
 
 
597 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  38.14 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  31.07 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36 
 
 
597 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  39.33 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  31.73 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  31.07 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  30.19 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.745288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  34.95 
 
 
102 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>