165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0688 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  100 
 
 		 119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  61.11 
 
 		 120 aa  160  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  67.62 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  58.88 
 
 		 114 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.745288 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  48.08 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  48.08 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  44.23 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  42.06 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  43.69 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  45.1 
 
 		 132 aa  103  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  45.1 
 
 		 132 aa  103  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  44.55 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  41.9 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  43.56 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  43.56 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  48 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  35.64 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  35.64 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  35.64 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  35.58 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  38.74 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  35.64 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  36.36 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  33.66 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  33.33 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  31.73 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  47.06 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  33.64 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  30.48 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  29.91 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  33.65 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  30.77 
 
 		 134 aa  67  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.97 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  33.98 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.33 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  29.81 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  34.26 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  34.26 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  30.48 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  30.56 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  32.41 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  33.62 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  32.04 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  28.97 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  28.57 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  25.83 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  29.46 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  32.41 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0160  hypothetical protein  37.08 
 
 		 290 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  26.88 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  30.28 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  32.71 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  31.07 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  30.28 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  30 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  29.73 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  30.3 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  29.91 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  32.71 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  32.71 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  25 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  32.41 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  29.63 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  28 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  32 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  25.96 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  30.19 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  36.11 
 
 		 614 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  31.48 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  30.19 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  40 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  31.48 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  28.28 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0333  ferredoxin, 2Fe-2S  32.63 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  30 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  29.29 
 
 		 572 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  27.1 
 
 		 607 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  27.1 
 
 		 607 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  28.44 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  28.57 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  30.56 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  29.36 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  30.56 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  30.56 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  26.92 
 
 		 610 aa  53.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  32.71 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  29.9 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  29.59 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  32.71 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  32.71 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  28.71 
 
 		 602 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  29.52 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  32.71 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  32.73 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  29.36 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  29.63 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  34.95 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  29.59 
 
 		 572 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  25.71 
 
 		 677 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>