217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  39.13 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1599  hypothetical protein  40.1 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  33.04 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  32.07 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  39.05 
 
 		 130 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40.22 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  41.3 
 
 		 597 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36.46 
 
 		 108 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  38.54 
 
 		 117 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4568  hypothetical protein  39.22 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  30.48 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 		 596 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  37.89 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  38 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  37.14 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  36.89 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  36.89 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  39.18 
 
 		 106 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  39 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  40 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  40 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  40 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  32.61 
 
 		 610 aa  70.9  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  36.26 
 
 		 597 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  38.82 
 
 		 569 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  34.86 
 
 		 117 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  31.63 
 
 		 602 aa  70.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  36.26 
 
 		 596 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  33.63 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  38.3 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  36.46 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  35.42 
 
 		 597 aa  68.6  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 		 595 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  34.31 
 
 		 130 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.04 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  32.38 
 
 		 110 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  32 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  36.45 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  35.16 
 
 		 597 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  32.35 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1539  hypothetical protein  37.62 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  31.78 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  36.36 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 603 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  37.63 
 
 		 598 aa  65.5  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  36 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  31.68 
 
 		 607 aa  65.1  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.29 
 
 		 677 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  31.68 
 
 		 607 aa  65.1  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  35.14 
 
 		 132 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  36.56 
 
 		 545 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  35.14 
 
 		 132 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  32.69 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  37.08 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  33.62 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  40.96 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  34.95 
 
 		 105 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 		 596 aa  63.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  31 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  31 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  31.63 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  27.72 
 
 		 594 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.33 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  34.09 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  36.05 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  37.76 
 
 		 128 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  31.68 
 
 		 106 aa  62  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1150  ferredoxin, 2Fe-2S  35.71 
 
 		 100 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  33.66 
 
 		 105 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  31.68 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  35.71 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  35.71 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  33.66 
 
 		 109 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  33.66 
 
 		 109 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  33 
 
 		 102 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  30.48 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  30.69 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  36.84 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  34.31 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  32.67 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  32.67 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  33.64 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  35.35 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  30.3 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  31.31 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  37.25 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.78 
 
 		 408 aa  58.2  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  28.87 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  32.04 
 
 		 105 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  31.68 
 
 		 105 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  27.55 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.745288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>