194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4923 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  100 
 
 		 117 aa  242  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  83.96 
 
 		 124 aa  190  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  76.92 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  73.04 
 
 		 116 aa  184  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  76.15 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  77.39 
 
 		 123 aa  183  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  75.22 
 
 		 113 aa  183  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  75.22 
 
 		 113 aa  183  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  80.19 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  79.25 
 
 		 107 aa  174  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  77.57 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  67.68 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  64.71 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  59.46 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  63.11 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  63.11 
 
 		 105 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  62.75 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  61.17 
 
 		 105 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  61.17 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  62.75 
 
 		 109 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  62.75 
 
 		 109 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  60.4 
 
 		 109 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  60.4 
 
 		 109 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  59.22 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  61.17 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  61.17 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  61.17 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  59.22 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  62.38 
 
 		 107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  61.39 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  62.75 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  62.75 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  62.75 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  62.75 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  62.75 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  56.73 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  56 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  57.84 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  60.4 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  58.42 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  57 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  53.47 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  49 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  54.9 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  54.9 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  47 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  47.96 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  44 
 
 		 108 aa  94.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  45.45 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  45.79 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  45.79 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  45.79 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  42.57 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  38.1 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  43.43 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  39.81 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  39.42 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  38.61 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  41 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  40 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  41.67 
 
 		 343 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  42.57 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  37.11 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  37.76 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  38.38 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  38 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  37.76 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  37 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  36 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  39.22 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  37.37 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  35.05 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  35.05 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  37.25 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  36.63 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 		 595 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  36.27 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  36.27 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  37.25 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  32.32 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  36.27 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  34.69 
 
 		 597 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  40.74 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  37.96 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  36.27 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  37.21 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2408  ferredoxin-like protein  46.55 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  50 
 
 		 597 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.33 
 
 		 408 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 614 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  36.89 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  33.67 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  34.95 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  36 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.29 
 
 		 410 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  42.47 
 
 		 572 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  34 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  46.3 
 
 		 598 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>