197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2621 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  100 
 
 		 132 aa  274  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  63.93 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 596 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  31.9 
 
 		 607 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  36.05 
 
 		 597 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  31.9 
 
 		 607 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  31.86 
 
 		 602 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  34.41 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  39.24 
 
 		 610 aa  70.1  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  34.07 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 		 596 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  35.63 
 
 		 572 aa  67  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  38.55 
 
 		 569 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  31.62 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  32.98 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  32.94 
 
 		 572 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  32.98 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  31.58 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  30.23 
 
 		 595 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  32.98 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  32.08 
 
 		 597 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  35.87 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  34.04 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  36.05 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  33.68 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  32.95 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  33.71 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  31.4 
 
 		 614 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  35.16 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  27.66 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  29.41 
 
 		 562 aa  60.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  30.69 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  31.46 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  27.27 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  27 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  32.58 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 		 640 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 597 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  32.5 
 
 		 640 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  27.27 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  32.58 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  32.58 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  32.91 
 
 		 641 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  29.29 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.72 
 
 		 636 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  27.52 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  31 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  32.58 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  27.52 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.72 
 
 		 636 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  31.91 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  26.32 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1111  hypothetical protein  36.25 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188451  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  36.67 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  32.53 
 
 		 597 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  29.79 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  33.33 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  28.28 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  32.22 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  32.93 
 
 		 603 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  28.75 
 
 		 626 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  28.75 
 
 		 623 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  27.27 
 
 		 623 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  28.83 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  28.57 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  28.05 
 
 		 614 aa  53.9  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  24.51 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  29.63 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.71 
 
 		 410 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2936  hypothetical protein  34.88 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  25 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  25 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  27.66 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  29.79 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  31.17 
 
 		 635 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.25 
 
 		 408 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  37.8 
 
 		 598 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  29.79 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.25 
 
 		 273 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  26.97 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  29.03 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  26.17 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  26.32 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  32.58 
 
 		 239 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  29.35 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  28.16 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  35 
 
 		 539 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  29.03 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  30.3 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 		 545 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  30.85 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  23.23 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.745288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  27.96 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  27.66 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  27.96 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  31.91 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  27.66 
 
 		 597 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  29.41 
 
 		 626 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  30.53 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>