195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01520 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  100 
 
 
107 aa  223  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  51.4 
 
 
108 aa  120  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  45.37 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  45.79 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  46.67 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  42.11 
 
 
103 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  46.15 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  42.22 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  42.39 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  38.89 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  45.56 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  44.44 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  37.25 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  38.89 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  38.89 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  38.14 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  33.33 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  37.74 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  35.48 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0333  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  34.04 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.87 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  32.35 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  35.92 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  35.92 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  34.44 
 
 
572 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  35.63 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  36.59 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  32.98 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  34.74 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1150  ferredoxin, 2Fe-2S  32.95 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  34.23 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  35.23 
 
 
597 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  36.63 
 
 
597 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  32.1 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  37.04 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  36.49 
 
 
626 aa  58.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
598 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  39.24 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  32.63 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  29.67 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  31.63 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  32.1 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  31.58 
 
 
102 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  30.39 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
640 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  30.48 
 
 
596 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  29.67 
 
 
562 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  29.67 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  28.26 
 
 
572 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  35.11 
 
 
610 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  38.03 
 
 
641 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  29.7 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  30.39 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  32.69 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  26.39 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  30.39 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  30.39 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  29.67 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  39.76 
 
 
626 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  39.76 
 
 
626 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  30.68 
 
 
597 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  35.63 
 
 
607 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  27.96 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1759  ferredoxin, 2Fe-2S  29.7 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.370583  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2619  ferredoxin, 2Fe-2S  31.68 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  35.63 
 
 
607 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  28.85 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  29.67 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  29.03 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  29.03 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  29.03 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  34.48 
 
 
602 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1863  cobalamin cluster protein CbiX 2 (ferredoxin- like iron-sulfur protein)  32.18 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  29.03 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  26.88 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  29.03 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  29.67 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  29.67 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  26.8 
 
 
569 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  29.79 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  27.66 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  29.03 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  29.03 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  28.87 
 
 
108 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  29.67 
 
 
105 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 
596 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  34.41 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  34.41 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  30.39 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.42 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.42 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  27.27 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  28.87 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  28.12 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  29.35 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  31.52 
 
 
343 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  31.65 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 
595 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  32.65 
 
 
132 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>