160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3789 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 273 aa  547  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  40.22 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4568  hypothetical protein  31.86 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  27.2 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 		 572 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1599  hypothetical protein  34.78 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  43.37 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  40.4 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.5 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  39.77 
 
 		 115 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  39.77 
 
 		 115 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  36.96 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  32.9 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  33 
 
 		 117 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.36 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  35.87 
 
 		 610 aa  65.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  30.23 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  33.7 
 
 		 116 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.45 
 
 		 410 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  32 
 
 		 118 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  30.11 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  30.11 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.21 
 
 		 677 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  34.15 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  31.76 
 
 		 572 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  30.23 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  39.73 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 597 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  27.78 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  30.34 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  28.87 
 
 		 602 aa  58.9  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  29.89 
 
 		 102 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  30.68 
 
 		 102 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  31.33 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  30.43 
 
 		 108 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  27.91 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  29.47 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  27.91 
 
 		 597 aa  55.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  29.47 
 
 		 133 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 112 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  28.28 
 
 		 134 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  30.43 
 
 		 106 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  30.43 
 
 		 120 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  34.31 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  28.72 
 
 		 103 aa  53.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  36.25 
 
 		 132 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  28.83 
 
 		 117 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 		 596 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  35 
 
 		 132 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  27.66 
 
 		 130 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  27.59 
 
 		 101 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  32.61 
 
 		 123 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  28.09 
 
 		 119 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  27.84 
 
 		 105 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  25.81 
 
 		 102 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  29.9 
 
 		 139 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  27.78 
 
 		 110 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  27.84 
 
 		 120 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  26.32 
 
 		 105 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  30.11 
 
 		 109 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  27.36 
 
 		 598 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  30.11 
 
 		 109 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  26.32 
 
 		 105 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  31.58 
 
 		 101 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  27.96 
 
 		 108 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  25.56 
 
 		 121 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  26.73 
 
 		 120 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  25 
 
 		 109 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  27.78 
 
 		 104 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  25.26 
 
 		 105 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  25.26 
 
 		 105 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  28.75 
 
 		 626 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  28 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  28.75 
 
 		 623 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  30.11 
 
 		 114 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  29.03 
 
 		 112 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  24.21 
 
 		 105 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  25.26 
 
 		 105 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  27.5 
 
 		 623 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  25 
 
 		 107 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  31.46 
 
 		 105 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.41 
 
 		 108 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  32.98 
 
 		 120 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  27.96 
 
 		 124 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  25.26 
 
 		 105 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 		 575 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  31.46 
 
 		 105 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 		 626 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  29.03 
 
 		 131 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  25 
 
 		 102 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  26.32 
 
 		 105 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  31.4 
 
 		 596 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  25.81 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2936  hypothetical protein  33.71 
 
 		 109 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  23.15 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  26.32 
 
 		 109 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  26.32 
 
 		 109 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>