162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1599 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1599  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  484  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  43.97 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  39.3 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.78 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  35.71 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  39.22 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4568  hypothetical protein  32.93 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  36.28 
 
 		 134 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  38.54 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  31.13 
 
 		 597 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  34.69 
 
 		 103 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  37.27 
 
 		 112 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  37.27 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  37.27 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  34.21 
 
 		 597 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  36.96 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  32.17 
 
 		 603 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  36.56 
 
 		 597 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  32.69 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  31.63 
 
 		 595 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  33.98 
 
 		 104 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  31.78 
 
 		 597 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  33.98 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  35.23 
 
 		 107 aa  62  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  25.64 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  35.71 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  32.97 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  32.61 
 
 		 115 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  32.61 
 
 		 115 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  35.16 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  32.93 
 
 		 575 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.52 
 
 		 677 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  33 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  27.84 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  35.23 
 
 		 569 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  33.64 
 
 		 109 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  31.58 
 
 		 117 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  33.7 
 
 		 116 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.78 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  37.65 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  33.64 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  32.63 
 
 		 97 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  26.09 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  26.09 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  32.63 
 
 		 97 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.16 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.26 
 
 		 103 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1111  hypothetical protein  38.95 
 
 		 102 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  34.94 
 
 		 113 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  29.91 
 
 		 596 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 		 570 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  27.55 
 
 		 102 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  30.68 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  26.8 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  25.58 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  32.38 
 
 		 597 aa  56.2  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  29.52 
 
 		 572 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  29.52 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  29.03 
 
 		 623 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  32.71 
 
 		 106 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  26.47 
 
 		 562 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 		 626 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  35.87 
 
 		 132 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3831  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.36 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  35.29 
 
 		 107 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  34.34 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  34.34 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  31.52 
 
 		 139 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  33.67 
 
 		 109 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  29.55 
 
 		 626 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  29.55 
 
 		 623 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  29.29 
 
 		 632 aa  53.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0844  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.923972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 		 610 aa  52.4  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 		 635 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  23.68 
 
 		 602 aa  52.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0098  ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 124 aa  52.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000332289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 		 592 aa  52  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4743  hypothetical protein  25.32 
 
 		 83 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  25.51 
 
 		 102 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  31.52 
 
 		 110 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  29.81 
 
 		 109 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  32.61 
 
 		 102 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  36 
 
 		 604 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  35.05 
 
 		 100 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  36.08 
 
 		 598 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.09 
 
 		 636 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  31 
 
 		 103 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  23.2 
 
 		 624 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 		 636 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  31.19 
 
 		 343 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0840  ferredoxin, 2fe-2s  30.61 
 
 		 100 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  26.75 
 
 		 162 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  31.18 
 
 		 102 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  27.18 
 
 		 105 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.33 
 
 		 410 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  35.62 
 
 		 600 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>