171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2739 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  100 
 
 		 104 aa  219  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  62.37 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  62.37 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2241  hypothetical protein  49.5 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  48.89 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4743  hypothetical protein  40.74 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  35.79 
 
 		 614 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36.63 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36.36 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  35.63 
 
 		 595 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  38.37 
 
 		 588 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  34.34 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 572 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  34.48 
 
 		 614 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.63 
 
 		 410 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  36.78 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  31.63 
 
 		 596 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  34.83 
 
 		 569 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1599  hypothetical protein  37.14 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 		 604 aa  57.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  30.59 
 
 		 597 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  34.38 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.03 
 
 		 408 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  30.23 
 
 		 572 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  31.68 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  34.69 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  32.18 
 
 		 597 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  32.04 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  32.29 
 
 		 623 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  36.67 
 
 		 603 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  31.68 
 
 		 620 aa  52  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  33.33 
 
 		 182 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  34.07 
 
 		 596 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  31.52 
 
 		 626 aa  52  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  31.52 
 
 		 623 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  30.77 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.56 
 
 		 597 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  43.4 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  28.74 
 
 		 597 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  27.66 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  37.04 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  29.55 
 
 		 635 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  28.57 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  29.79 
 
 		 570 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 		 575 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  29.67 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  29.35 
 
 		 626 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  29.35 
 
 		 626 aa  50.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 		 597 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  30.21 
 
 		 624 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 632 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  29.55 
 
 		 219 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.58 
 
 		 677 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  32.99 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 		 610 aa  50.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  40 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  27.63 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  46.81 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  46.81 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  30.21 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  28.12 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  28.12 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  37.93 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 		 602 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  32.47 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  33.65 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  31.76 
 
 		 629 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  36.76 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  29.81 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  32.14 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  29.81 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  37.93 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.29 
 
 		 623 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.33 
 
 		 410 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  41.51 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  34.41 
 
 		 600 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  42 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 		 607 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  29.81 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 		 607 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  36.76 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  32.18 
 
 		 592 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.47 
 
 		 636 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  37.93 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  36.23 
 
 		 113 aa  48.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  36.23 
 
 		 113 aa  48.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  29.47 
 
 		 640 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  28.12 
 
 		 623 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  30.59 
 
 		 636 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  27.66 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  43.14 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  43.14 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  43.14 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  43.14 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  38.64 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1539  hypothetical protein  29.47 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0844  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.88 
 
 		 291 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.923972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  30.43 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  32.93 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>