88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0844 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0844  putative iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 
291 aa  603  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.923972  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0160  hypothetical protein  63.07 
 
 
290 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2252  hypothetical protein  38.2 
 
 
191 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0245385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3090  hypothetical protein  37.64 
 
 
191 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3545  hypothetical protein  36.05 
 
 
186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  32.99 
 
 
118 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  37.23 
 
 
596 aa  60.1  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  31.31 
 
 
107 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.04 
 
 
595 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  29.29 
 
 
607 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  29.29 
 
 
607 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
596 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  31.18 
 
 
572 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  34.52 
 
 
116 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  34.88 
 
 
130 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
588 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  28.87 
 
 
117 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  34.02 
 
 
109 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  26.26 
 
 
602 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  29.79 
 
 
569 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  26.88 
 
 
109 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  38 
 
 
114 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.745288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.76 
 
 
597 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  34.88 
 
 
575 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.46 
 
 
677 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  27.27 
 
 
115 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  32.63 
 
 
535 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  27.27 
 
 
115 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  33.72 
 
 
614 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  31.46 
 
 
539 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 
614 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 
596 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  33.75 
 
 
119 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
535 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.06 
 
 
408 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  38.71 
 
 
130 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 
597 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  34.88 
 
 
104 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  28.09 
 
 
116 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  31.17 
 
 
113 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  29.13 
 
 
112 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  29.49 
 
 
610 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  29.47 
 
 
597 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  32.29 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  26.47 
 
 
113 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  31.25 
 
 
178 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  48.78 
 
 
128 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
562 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  37.5 
 
 
114 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.36 
 
 
410 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2093  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  28.72 
 
 
97 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  27.47 
 
 
597 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  28.72 
 
 
97 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  25 
 
 
102 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
603 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  31.08 
 
 
598 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1599  hypothetical protein  26.27 
 
 
246 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  25.84 
 
 
116 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  41.46 
 
 
158 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  41.46 
 
 
158 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  30.85 
 
 
105 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  28.21 
 
 
112 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  30.85 
 
 
105 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  25.93 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  29.63 
 
 
120 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.76 
 
 
410 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.33 
 
 
117 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  28.21 
 
 
112 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  29.89 
 
 
127 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0911  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  29.17 
 
 
162 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  32.81 
 
 
132 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  32.81 
 
 
132 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0933  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.17 
 
 
162 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  28.21 
 
 
112 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  41.46 
 
 
147 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  31.03 
 
 
117 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0995  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28 
 
 
164 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.41379  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0912  ferredoxin-like protein  27.19 
 
 
126 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0934  ferredoxin-like protein  27.19 
 
 
126 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  30.12 
 
 
123 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  28.12 
 
 
102 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  29.07 
 
 
572 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  31.33 
 
 
113 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  31.33 
 
 
113 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  28.21 
 
 
121 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  27.96 
 
 
626 aa  42.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  27.17 
 
 
219 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>