170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4280 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  35.59 
 
 		 193 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  41.9 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  35.41 
 
 		 182 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  35.41 
 
 		 182 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0568  hypothetical protein  37.8 
 
 		 194 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3959  hypothetical protein  29.95 
 
 		 188 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000666734  hitchhiker  0.00242089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  26.64 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1801  hypothetical protein  28.1 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1369  nucleic acid-binding OB-fold tRNA/helicase-type protein  26.39 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1773  hypothetical protein  27.62 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2372  hypothetical protein  28.91 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  34.62 
 
 		 623 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  33.77 
 
 		 623 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  28.75 
 
 		 597 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  34.18 
 
 		 569 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  33.78 
 
 		 626 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.63 
 
 		 677 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.5 
 
 		 636 aa  61.6  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 		 636 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  30 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  27.27 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  27.27 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  27.27 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  28.41 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  27.59 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  28.75 
 
 		 595 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 		 572 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  31.25 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4743  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  23.75 
 
 		 596 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  25 
 
 		 597 aa  58.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 		 562 aa  56.6  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  26.58 
 
 		 113 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 		 598 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  27.38 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  26.39 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  28.21 
 
 		 592 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  30.21 
 
 		 109 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  32.47 
 
 		 575 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  27.5 
 
 		 97 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 		 604 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  27.5 
 
 		 97 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  26.67 
 
 		 120 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  28.89 
 
 		 626 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  24.64 
 
 		 130 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  28.89 
 
 		 626 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  25.35 
 
 		 108 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  26.14 
 
 		 106 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  29.35 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  28.4 
 
 		 572 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  28.75 
 
 		 614 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2936  hypothetical protein  30.49 
 
 		 109 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  25.97 
 
 		 602 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  28.41 
 
 		 570 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  28.77 
 
 		 635 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  26.58 
 
 		 597 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  22.5 
 
 		 597 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  29.87 
 
 		 603 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  32.43 
 
 		 640 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2108  hypothetical protein  29.17 
 
 		 83 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  26.92 
 
 		 121 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  27.5 
 
 		 596 aa  50.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.33 
 
 		 110 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2173  hypothetical protein  24.06 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  27.63 
 
 		 104 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  23.86 
 
 		 103 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  25.61 
 
 		 624 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 		 610 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  21.79 
 
 		 614 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2241  hypothetical protein  28.57 
 
 		 109 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  28.38 
 
 		 641 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  29.58 
 
 		 105 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  49.3  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  26.19 
 
 		 100 aa  49.3  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  23.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  28.17 
 
 		 105 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  29.11 
 
 		 109 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  30.95 
 
 		 117 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  34.38 
 
 		 134 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  30.56 
 
 		 123 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  38.64 
 
 		 107 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  38.64 
 
 		 102 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  25.58 
 
 		 102 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  27.54 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  37.21 
 
 		 105 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  30.86 
 
 		 535 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  23.38 
 
 		 607 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.15 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  23.38 
 
 		 607 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  27.85 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  29.73 
 
 		 640 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  34.04 
 
 		 108 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  34.38 
 
 		 106 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  34.09 
 
 		 127 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  34.09 
 
 		 107 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  25 
 
 		 594 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>