40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3959 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3959  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  381  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000666734  hitchhiker  0.00242089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1369  nucleic acid-binding OB-fold tRNA/helicase-type protein  66.29 
 
 		 188 aa  227  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1801  hypothetical protein  42.46 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1773  hypothetical protein  41.9 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  40.68 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  40.68 
 
 		 182 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  37.7 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0568  hypothetical protein  39.77 
 
 		 194 aa  108  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  40.44 
 
 		 219 aa  107  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2372  hypothetical protein  35.98 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  29.95 
 
 		 222 aa  92.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  31.89 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2173  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  28.21 
 
 		 597 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  31.87 
 
 		 626 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  31.87 
 
 		 626 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  28.12 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 		 602 aa  46.2  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  28.95 
 
 		 610 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  28.4 
 
 		 596 aa  45.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  31.46 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2108  hypothetical protein  31.51 
 
 		 83 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  23.68 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  25.32 
 
 		 597 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1111  hypothetical protein  29.27 
 
 		 102 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  25.93 
 
 		 113 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  29.67 
 
 		 569 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  29.85 
 
 		 603 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  26.58 
 
 		 120 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  22.22 
 
 		 614 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  25.64 
 
 		 597 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  21.92 
 
 		 108 aa  41.6  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  24.36 
 
 		 535 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  27.16 
 
 		 97 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  27.16 
 
 		 97 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  25 
 
 		 102 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  24.36 
 
 		 535 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  29.67 
 
 		 590 aa  41.2  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3925  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  29.09 
 
 		 562 aa  41.2  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2098  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  27.33 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>