46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2372 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2372  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1801  hypothetical protein  39.58 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1773  hypothetical protein  39.06 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3959  hypothetical protein  35.98 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000666734  hitchhiker  0.00242089 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  33.51 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  34.27 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  34.27 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1369  nucleic acid-binding OB-fold tRNA/helicase-type protein  33.16 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0568  hypothetical protein  32.07 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  34.03 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  28.91 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 		 569 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2108  hypothetical protein  32.43 
 
 		 83 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  28.09 
 
 		 535 aa  48.5  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  35 
 
 		 626 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 		 610 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  35 
 
 		 626 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  34.55 
 
 		 597 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 		 595 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  25.33 
 
 		 594 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 592 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  36.36 
 
 		 623 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 		 623 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  36.36 
 
 		 626 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  32.2 
 
 		 562 aa  45.1  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 		 603 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  32.86 
 
 		 100 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2936  hypothetical protein  35.85 
 
 		 109 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 572 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  28.4 
 
 		 100 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  28.17 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36.17 
 
 		 108 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  32.73 
 
 		 597 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  27.27 
 
 		 100 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  32.73 
 
 		 596 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  32.73 
 
 		 572 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 		 535 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  38.18 
 
 		 635 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 		 535 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  31.08 
 
 		 626 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 		 596 aa  42  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  30.91 
 
 		 607 aa  41.6  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  30.91 
 
 		 607 aa  41.6  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  23.33 
 
 		 100 aa  41.6  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36769  predicted protein  32.73 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>