26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1801 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1801  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1773  hypothetical protein  99.49 
 
 
198 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3959  hypothetical protein  42.46 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000666734  hitchhiker  0.00242089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  37.22 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  37.22 
 
 
182 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1369  nucleic acid-binding OB-fold tRNA/helicase-type protein  39.78 
 
 
188 aa  121  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2372  hypothetical protein  39.58 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0698153  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  35.2 
 
 
193 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0568  hypothetical protein  34.64 
 
 
194 aa  101  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  33.84 
 
 
219 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  31.87 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  28.1 
 
 
222 aa  77  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  30.59 
 
 
132 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  28.21 
 
 
113 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  28.24 
 
 
562 aa  48.5  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  25.64 
 
 
603 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  27.16 
 
 
595 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  27.16 
 
 
217 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  24.73 
 
 
614 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  26.92 
 
 
610 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  25.64 
 
 
602 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  26.92 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  23.23 
 
 
626 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  19.75 
 
 
597 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  27.63 
 
 
539 aa  42  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  25.93 
 
 
569 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>