197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2317 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 
107 aa  222  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  55.14 
 
 
108 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  54.63 
 
 
109 aa  120  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  54.55 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  52.94 
 
 
109 aa  110  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  45.79 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  45.54 
 
 
102 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  45.54 
 
 
102 aa  99  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  45.92 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  45.92 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  45.92 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  43.56 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  46 
 
 
102 aa  93.6  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  46.81 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  46.94 
 
 
114 aa  90.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  45.45 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  42.86 
 
 
117 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  45.1 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  41.84 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  42.11 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  41.05 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  37.89 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  41.24 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  37.89 
 
 
572 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  37.89 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  44.3 
 
 
626 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  41.67 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  36.63 
 
 
597 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  36 
 
 
595 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  41.05 
 
 
597 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  38.61 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  37 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  37.74 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  37.86 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  35.51 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  35.24 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  39.6 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  39.6 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  39.6 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  40.19 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  39.6 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  40.19 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  33.02 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  37.23 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  40.96 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  37.23 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  38.61 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  38.61 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  40.78 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  38.61 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  37 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  38.61 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  38.61 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  40.78 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  38.61 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  38.61 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  37 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  37 
 
 
596 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  34.31 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  37 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  35.85 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  39.74 
 
 
641 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  31.13 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  39.22 
 
 
108 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  34.38 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  39.22 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  36.89 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  36 
 
 
104 aa  60.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  36.67 
 
 
607 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  35.42 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  36.67 
 
 
607 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 
596 aa  60.5  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  38.24 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  38.61 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0333  ferredoxin, 2Fe-2S  29.52 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  32.63 
 
 
572 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  35.42 
 
 
597 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  38.61 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  35.19 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  38.61 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  38.61 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  34.02 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  32.04 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1759  ferredoxin, 2Fe-2S  31.07 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.370583  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  37.18 
 
 
640 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.04 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  34.04 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  33.65 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  43.37 
 
 
592 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  33.68 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  37.33 
 
 
598 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  34.95 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  36.27 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  35.9 
 
 
594 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.08 
 
 
410 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  32.63 
 
 
597 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  34.04 
 
 
569 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
626 aa  57  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
626 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  38.83 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>