111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2250 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  503  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  50.21 
 
 
239 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  32.07 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1599  hypothetical protein  37.66 
 
 
246 aa  72  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4568  hypothetical protein  31.97 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.9 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1759  ferredoxin, 2Fe-2S  35.53 
 
 
103 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.370583  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  35.71 
 
 
102 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
562 aa  58.5  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 
596 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  37.33 
 
 
103 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  35.21 
 
 
102 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  38.14 
 
 
109 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  38.95 
 
 
100 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  34.07 
 
 
106 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  34.48 
 
 
572 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  31 
 
 
132 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
597 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  33.8 
 
 
102 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1150  ferredoxin, 2Fe-2S  36.47 
 
 
100 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  29.25 
 
 
105 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  36.84 
 
 
102 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  29.76 
 
 
597 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  36.62 
 
 
102 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  34.21 
 
 
102 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  40.91 
 
 
603 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  33.8 
 
 
569 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  35.53 
 
 
102 aa  52.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
595 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  30.43 
 
 
132 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  36.67 
 
 
114 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  28.57 
 
 
597 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  32.26 
 
 
105 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2408  ferredoxin-like protein  44 
 
 
62 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  29.23 
 
 
572 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  36.62 
 
 
112 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  32.39 
 
 
103 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  36.62 
 
 
112 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  24.18 
 
 
602 aa  49.3  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  36.62 
 
 
112 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  29.69 
 
 
596 aa  48.5  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  32.93 
 
 
102 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  28.72 
 
 
105 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2936  hypothetical protein  34.88 
 
 
109 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.29 
 
 
102 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  27 
 
 
105 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  27.91 
 
 
597 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2619  ferredoxin, 2Fe-2S  39.74 
 
 
100 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  30.77 
 
 
105 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  28.72 
 
 
105 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  28.72 
 
 
105 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  30.77 
 
 
109 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  30.77 
 
 
109 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  28.72 
 
 
105 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  37.18 
 
 
114 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  30.26 
 
 
102 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  35.21 
 
 
134 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  34.33 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  31.87 
 
 
107 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.08 
 
 
410 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  25.29 
 
 
610 aa  45.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 
598 aa  45.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  31.58 
 
 
104 aa  45.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  30.33 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  27.78 
 
 
575 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  32.65 
 
 
112 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  27.66 
 
 
105 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  30.16 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  27.66 
 
 
105 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  37.25 
 
 
101 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  28.57 
 
 
124 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  37.93 
 
 
109 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  34.15 
 
 
108 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  25.84 
 
 
614 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.56 
 
 
408 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  36.23 
 
 
118 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  27.17 
 
 
677 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  38.89 
 
 
128 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  30.3 
 
 
103 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  34.78 
 
 
130 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  28.71 
 
 
115 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  28.71 
 
 
115 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.25 
 
 
636 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  25.84 
 
 
121 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.96 
 
 
410 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  30.39 
 
 
343 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  34.88 
 
 
106 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35.82 
 
 
108 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  26.04 
 
 
106 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  24.21 
 
 
113 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  33.33 
 
 
101 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.06 
 
 
117 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  29.73 
 
 
130 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  26.74 
 
 
107 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  35.09 
 
 
636 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  24.39 
 
 
623 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  23.08 
 
 
607 aa  42.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  23.08 
 
 
607 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  36.21 
 
 
182 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>