161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1759 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1759  ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 
103 aa  210  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.370583  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  92.23 
 
 
103 aa  199  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  81.37 
 
 
102 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  81.37 
 
 
102 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  79.41 
 
 
102 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  79.41 
 
 
102 aa  178  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  79.21 
 
 
102 aa  174  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  56.44 
 
 
106 aa  120  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2619  ferredoxin, 2Fe-2S  50.5 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1150  ferredoxin, 2Fe-2S  52.94 
 
 
100 aa  111  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  48.04 
 
 
100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0840  ferredoxin, 2fe-2s  47.47 
 
 
100 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  41.75 
 
 
102 aa  94  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  41.18 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  42.11 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  36.27 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.71 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  34.69 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  34.12 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  34.65 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  34.44 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  34.65 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  34.65 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  32.99 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  34.12 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  34.12 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  34.12 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  33.7 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  28.71 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  35.53 
 
 
249 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  35.14 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  32.67 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  31.96 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  30.69 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  31.07 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  31.96 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  29.79 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  29.79 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  34.65 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  29.79 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  29.79 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  34.65 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  34.65 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  34.65 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  29.79 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  33.73 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  29.79 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  31.07 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  31.37 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  30.77 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  29.7 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  30.23 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  30 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  30.48 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  29 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  29.25 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  30 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  30.68 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  31.46 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  31.11 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  29.29 
 
 
217 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  26.44 
 
 
102 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  31.68 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.18 
 
 
597 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  31.68 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  32.95 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
600 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  31.31 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  27.27 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  28 
 
 
677 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  26.37 
 
 
569 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
640 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  34.62 
 
 
204 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  31.73 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  34.25 
 
 
120 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  27.45 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  36.11 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  41.82 
 
 
575 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  34.72 
 
 
537 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  29 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.57 
 
 
343 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  29.29 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  31 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  29.52 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0333  ferredoxin, 2Fe-2S  29.41 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  31 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  32.04 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  27 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  29.76 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  29.9 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  34.52 
 
 
596 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  27.72 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  30.77 
 
 
101 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  34.48 
 
 
100 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  27.37 
 
 
120 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  40 
 
 
107 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  31.43 
 
 
116 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  29.79 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>