182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2308 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  100 
 
 		 101 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  80.2 
 
 		 101 aa  176  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  66.99 
 
 		 103 aa  144  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  58.82 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  59.41 
 
 		 104 aa  133  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  61 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  62.14 
 
 		 103 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  64.36 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  61.17 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  61.17 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  61.17 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  64 
 
 		 124 aa  131  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  59.22 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  66.67 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  59.41 
 
 		 109 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  59.8 
 
 		 134 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  59.41 
 
 		 109 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  61.76 
 
 		 105 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  63.27 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  65.31 
 
 		 113 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  65.31 
 
 		 113 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  58.25 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  57.28 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  60.4 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  58.25 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  58.25 
 
 		 105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  58.25 
 
 		 105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  58.25 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  59.8 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  60.4 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  63.64 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  58.25 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  58.42 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  61.17 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  57.28 
 
 		 105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  61.17 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  61.17 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  57.28 
 
 		 105 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  61.17 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  55.56 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  60.4 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  53.92 
 
 		 102 aa  123  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  57.84 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  57.84 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  62.38 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  46.46 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  43.14 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  41.18 
 
 		 105 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  44.55 
 
 		 112 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  44.55 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  44.55 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  41.35 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  42.31 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  42.57 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  39.22 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  38.78 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  39.6 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  37.62 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  36.46 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  38.61 
 
 		 343 aa  70.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  38.38 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  33 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  37 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  37 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  34.95 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  37.36 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  37.36 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 		 597 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  36.63 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  35 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  34 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  36 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  36 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  39.6 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.99 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  34.29 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  35.42 
 
 		 572 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  31.37 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  39.13 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  49.09 
 
 		 598 aa  63.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  38.1 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  37.37 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  33 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.66 
 
 		 597 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2408  ferredoxin-like protein  50 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 		 596 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  36.73 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.08 
 
 		 408 aa  61.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  31.37 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 		 595 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  34 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  32.35 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  36.56 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.05 
 
 		 410 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  32 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  32.04 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  36.19 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>