More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3788 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
144 aa  294  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  67.81 
 
 
146 aa  209  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  63.45 
 
 
173 aa  190  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  63.95 
 
 
147 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  63.95 
 
 
147 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  60.27 
 
 
156 aa  185  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  60.4 
 
 
148 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  59.73 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  57.04 
 
 
155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  56.76 
 
 
180 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  55.56 
 
 
164 aa  162  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  51.06 
 
 
155 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  48.65 
 
 
154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  49.66 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  52.03 
 
 
158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  50.68 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  59.43 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  39.61 
 
 
218 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
142 aa  120  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  40.94 
 
 
149 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 
148 aa  107  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.26 
 
 
147 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 
147 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
146 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
146 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
147 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
147 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
147 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
161 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
147 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
145 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  39.19 
 
 
158 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  35.14 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
148 aa  94  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
151 aa  93.6  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
165 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 
151 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  34.87 
 
 
171 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 
166 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
141 aa  90.5  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  38.21 
 
 
150 aa  90.5  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 
148 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 
185 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 
185 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
169 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  38.1 
 
 
153 aa  86.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
176 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  34.71 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  32.67 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  31.08 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
143 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
147 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  33.08 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  40.38 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  39.6 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>