More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3209 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  94.15 
 
 
188 aa  362  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  77.13 
 
 
188 aa  307  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  77.13 
 
 
188 aa  295  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  71.28 
 
 
188 aa  284  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  72.34 
 
 
188 aa  280  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  72.34 
 
 
188 aa  280  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  72.34 
 
 
188 aa  280  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  65.96 
 
 
188 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  65.96 
 
 
188 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  65.96 
 
 
188 aa  258  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  65.96 
 
 
188 aa  258  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  65.43 
 
 
188 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  65.43 
 
 
188 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  65.43 
 
 
188 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  65.43 
 
 
188 aa  254  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  65.43 
 
 
187 aa  254  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  64.89 
 
 
188 aa  254  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  63.83 
 
 
269 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  63.83 
 
 
188 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  63.83 
 
 
188 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  63.3 
 
 
188 aa  247  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  63.3 
 
 
188 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  45.41 
 
 
200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.09 
 
 
201 aa  164  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  44.44 
 
 
202 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  44.44 
 
 
202 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  44.44 
 
 
202 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.97 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  41.18 
 
 
200 aa  140  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.89 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  37.99 
 
 
212 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  37.84 
 
 
204 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.36 
 
 
197 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  40.56 
 
 
194 aa  121  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  37.36 
 
 
200 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.84 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  39.77 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.36 
 
 
202 aa  114  7.999999999999999e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  33.52 
 
 
219 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
215 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 
201 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  32.97 
 
 
238 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.76 
 
 
254 aa  99  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.45 
 
 
229 aa  98.6  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  36.17 
 
 
233 aa  97.8  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  33.86 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.64 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.33 
 
 
234 aa  95.9  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.96 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  28.96 
 
 
216 aa  95.5  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  30.37 
 
 
236 aa  94.7  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  28.34 
 
 
227 aa  94.7  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.11 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.24 
 
 
244 aa  94  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  32.63 
 
 
232 aa  94  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  32.09 
 
 
456 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  32.09 
 
 
456 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.85 
 
 
219 aa  92.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  34.04 
 
 
232 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.78 
 
 
193 aa  92  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  32.09 
 
 
456 aa  92  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.49 
 
 
221 aa  91.7  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.15 
 
 
217 aa  91.3  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.86 
 
 
233 aa  91.3  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  32.64 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.85 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.22 
 
 
231 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.81 
 
 
232 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  34.25 
 
 
216 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  34.25 
 
 
216 aa  89.4  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  30.65 
 
 
220 aa  88.6  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
396 aa  89  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.09 
 
 
216 aa  87.8  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
221 aa  87  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  33.92 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  30.37 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.02 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
225 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.76 
 
 
203 aa  85.5  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  30.89 
 
 
219 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  32.11 
 
 
230 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.65 
 
 
217 aa  85.1  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.41 
 
 
223 aa  84.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.12 
 
 
233 aa  84.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.53 
 
 
218 aa  84.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
221 aa  84.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.18 
 
 
218 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.87 
 
 
238 aa  84.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
986 aa  84.7  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  29.59 
 
 
219 aa  84.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  28.65 
 
 
228 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  30.6 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  31.18 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>