More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2146 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 326 aa  665    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  93.56 
 
 		 326 aa  617  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0409  Luciferase-like monooxygenase  63.69 
 
 		 329 aa  407  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0527  Luciferase-like monooxygenase  62.69 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  52.58 
 
 		 333 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  51.68 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2562  luciferase family protein  50.61 
 
 		 323 aa  312  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  48.92 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  47.88 
 
 		 389 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  47.88 
 
 		 389 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  47.11 
 
 		 386 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  48.77 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  47.09 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  47.09 
 
 		 375 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  47.09 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  47.09 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  47.09 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  47.09 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  45.87 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  45.4 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  45.4 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  47.22 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  45.4 
 
 		 349 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  45.09 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  43.56 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  45.4 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  44.48 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  44.17 
 
 		 349 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  48.31 
 
 		 265 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  41.74 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  42.14 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  42.14 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  41.84 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  41.54 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  41.07 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  41.54 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  41.54 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  41.54 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  41.02 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.84 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  34.62 
 
 		 345 aa  179  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.33 
 
 		 349 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  35.98 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  35.03 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  34.76 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  35.14 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  33.76 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  35.82 
 
 		 348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  35.93 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.19 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  36.5 
 
 		 348 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  36.06 
 
 		 351 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  33.71 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  33.71 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  34.04 
 
 		 334 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0372  luciferase family protein  33.53 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0382  luciferase family protein  33.53 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  35.52 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  33.63 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  33.43 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  36.13 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  36.01 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  34.51 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  36.04 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  38.49 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  32.63 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  32.33 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  31.69 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  32.12 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  32.33 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  32.33 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  32.33 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  32.23 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  32.33 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  32.15 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  32.33 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  37.66 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  32.33 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  33.53 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  34.56 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  37.66 
 
 		 335 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  32.53 
 
 		 338 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  37.92 
 
 		 335 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2237  luciferase family protein  35.98 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  32.91 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  32.15 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  32.02 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  33.53 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  37.5 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3497  luciferase family oxidoreductase, group 1  32.36 
 
 		 346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  33.43 
 
 		 365 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  31.86 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  31.96 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  32.93 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  31.36 
 
 		 335 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1187  luciferase family protein  32.9 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  31.07 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  36.9 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>