More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72030 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  71.82 
 
 		 294 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  53.39 
 
 		 257 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  49.64 
 
 		 276 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  47.66 
 
 		 278 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  43.89 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  32.65 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  32.42 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  23.32 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  24.17 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.35 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  25.73 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.71 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.83 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  23.51 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  25.9 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.92 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 1106 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.63 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.63 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3607  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.94 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.38 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 240 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 710 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335663  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  37.68 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.86 
 
 		 235 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2184  Methyltransferase type 11  28.34 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5473  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 711 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  34 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  35.85 
 
 		 344 aa  52.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.6 
 
 		 207 aa  52.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  52.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  31.11 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  23.6 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 634 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  23.42 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.33 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.88 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.86 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1255  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.34 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.33 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.41 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 		 1314 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1424  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.69 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.21 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 1312 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>