75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54580 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54580  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000205285  normal  0.0470051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4769  hypothetical protein  96.52 
 
 		 345 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1350  putative ammonia monooxygenase  68.51 
 
 		 343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1415  hypothetical protein  67.93 
 
 		 351 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4396  membrane protein AbrB duplication  67.64 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4306  putative ammonia monooxygenase  67.35 
 
 		 351 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  66.37 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3969  putative ammonia monooxygenase  68.45 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.997926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4235  hypothetical protein  67.75 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1454  putative ammonia monooxygenase  64.58 
 
 		 340 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49500  ammonia monooxygenase  58.11 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00868936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  40.35 
 
 		 352 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3432  putative ammonia monooxygenase  40.37 
 
 		 371 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1117  membrane protein AbrB duplication  37.88 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0442  putative ammonia monooxygenase  37.88 
 
 		 375 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4786  membrane protein AbrB duplication  39.02 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  26.9 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  27.65 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  28.24 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  28.61 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  26.99 
 
 		 352 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  22.71 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  25.31 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0189  membrane protein AbrB duplication  26.69 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.331047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2810  membrane protein AbrB duplication  26.21 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3161  putative ammonia monooxygenase  31.65 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0647069 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  27.51 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0549  membrane protein AbrB duplication  32.42 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0967394  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1230  hypothetical protein  22.55 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.180741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  27.12 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  30 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0324  putative ammonia monooxygenase  23.96 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  27.46 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  26.12 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  22.29 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1768  membrane protein AbrB duplication  27.97 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  27.36 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1772  membrane protein AbrB duplication  27.61 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  28.21 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4829  putative ammonia monooxygenase  30.29 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7367  AbrB protein (AidB regulator)  28.14 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4903  putative ammonia monooxygenase  25.6 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.080717  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0301  putative ammonia monooxygenase  26.52 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0363814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2439  putative ammonia monooxygenase  28.57 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.246402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0727  membrane protein AbrB duplication  29.55 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1961  putative ammonia monooxygenase  27.04 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1609  putative ammonia monooxygenase  28.3 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1451  hypothetical protein  27.38 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  27.46 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  26.58 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  22.77 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1243  putative ammonia monooxygenase  29.43 
 
 		 383 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962902  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  22.77 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2794  putative ammonia monooxygenase  26.78 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1260  putative ammonia monooxygenase  29.94 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  23.86 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3407  membrane protein AbrB duplication  30.47 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  25.85 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0637  putative ammonia monooxygenase  26.53 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3536  membrane protein AbrB duplication  29.5 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3212  membrane protein AbrB duplication  28.47 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  25.5 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5251  membrane protein AbrB duplication  28.02 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0626  putative ammonia monooxygenase  26.88 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  25.78 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  25.78 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  25.78 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  25.78 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14811  hypothetical protein  29.65 
 
 		 173 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686917  normal  0.0260683 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4953  putative ammonia monooxygenase  24.33 
 
 		 356 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365328  normal  0.422163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1270  putative ammonia monooxygenase  29.63 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  26.88 
 
 		 383 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4538  putative ammonia monooxygenase  25.73 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0824  hypothetical protein  26 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2961  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  25.78 
 
 		 348 aa  42.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>